Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39,6■■■■□ 3,93
Gfra2O08842 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36,53■■■■□ 3,44
Gfra2O08842 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3,35
Gfra2O08842 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,85■■■■□ 3,17
Gfra2O08842 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34,75■■■■□ 3,15
Gfra2O08842 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34,31■■■■□ 3,08
Gfra2O08842 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Gfra2O08842 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34,1■■■■□ 3,05
Gfra2O08842 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,73■■■□□ 2,99
Gfra2O08842 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
Gfra2O08842 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Gfra2O08842 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33,06■■■□□ 2,88
Gfra2O08842 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Gfra2O08842 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Gfra2O08842 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Gfra2O08842 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,55■■■□□ 2,8
Gfra2O08842 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,79
Gfra2O08842 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Gfra2O08842 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,2■■■□□ 2,75
Gfra2O08842 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,19■■■□□ 2,74
Gfra2O08842 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Gfra2O08842 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32,07■■■□□ 2,72
Gfra2O08842 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
Gfra2O08842 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Gfra2O08842 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,93■■■□□ 2,7
Gfra2O08842 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Gfra2O08842 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,89■■■□□ 2,7
Gfra2O08842 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31,84■■■□□ 2,69
Gfra2O08842 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31,71■■■□□ 2,67
Gfra2O08842 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Gfra2O08842 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,43■■■□□ 2,62
Gfra2O08842 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Gfra2O08842 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Gfra2O08842 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Gfra2O08842 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,3■■■□□ 2,6
Gfra2O08842 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31,25■■■□□ 2,59
Gfra2O08842 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Gfra2O08842 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Gfra2O08842 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31,11■■■□□ 2,57
Gfra2O08842 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Gfra2O08842 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Gfra2O08842 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Gfra2O08842 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,71■■■□□ 2,51
Gfra2O08842 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Gfra2O08842 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Gfra2O08842 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30,63■■■□□ 2,49
Gfra2O08842 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Gfra2O08842 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30,55■■■□□ 2,48
Gfra2O08842 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30,54■■■□□ 2,48
Gfra2O08842 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Gfra2O08842 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,48■■■□□ 2,47
Gfra2O08842 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Gfra2O08842 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30,3■■■□□ 2,44
Gfra2O08842 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Gfra2O08842 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Gfra2O08842 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Gfra2O08842 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,21■■■□□ 2,43
Gfra2O08842 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30,15■■■□□ 2,42
Gfra2O08842 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30,12■■■□□ 2,41
Gfra2O08842 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Gfra2O08842 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Gfra2O08842 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Gfra2O08842 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,96■■■□□ 2,39
Gfra2O08842 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Gfra2O08842 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Gfra2O08842 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Gfra2O08842 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Gfra2O08842 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Gfra2O08842 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Gfra2O08842 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29,84■■■□□ 2,37
Gfra2O08842 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Gfra2O08842 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Gfra2O08842 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Gfra2O08842 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29,75■■■□□ 2,35
Gfra2O08842 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Gfra2O08842 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29,72■■■□□ 2,35
Gfra2O08842 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Gfra2O08842 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29,7■■■□□ 2,35
Gfra2O08842 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Gfra2O08842 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29,6■■■□□ 2,33
Gfra2O08842 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,59■■■□□ 2,33
Gfra2O08842 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,59■■■□□ 2,33
Gfra2O08842 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Gfra2O08842 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Gfra2O08842 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Gfra2O08842 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Gfra2O08842 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Gfra2O08842 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29,4■■■□□ 2,3
Gfra2O08842 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Gfra2O08842 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Gfra2O08842 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29,32■■■□□ 2,28
Gfra2O08842 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Gfra2O08842 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Gfra2O08842 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Gfra2O08842 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Gfra2O08842 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Gfra2O08842 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Gfra2O08842 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29,11■■■□□ 2,25
Gfra2O08842 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Gfra2O08842 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29,07■■■□□ 2,24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80,6 ms