Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
SmgcF6VRN1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SmgcF6VRN1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SmgcF6VRN1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SmgcF6VRN1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SmgcF6VRN1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
SmgcF6VRN1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SmgcF6VRN1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SmgcF6VRN1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
SmgcF6VRN1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SmgcF6VRN1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SmgcF6VRN1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
SmgcF6VRN1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
SmgcF6VRN1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SmgcF6VRN1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SmgcF6VRN1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SmgcF6VRN1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SmgcF6VRN1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SmgcF6VRN1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SmgcF6VRN1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SmgcF6VRN1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SmgcF6VRN1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SmgcF6VRN1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SmgcF6VRN1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SmgcF6VRN1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SmgcF6VRN1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
SmgcF6VRN1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SmgcF6VRN1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SmgcF6VRN1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SmgcF6VRN1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SmgcF6VRN1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SmgcF6VRN1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SmgcF6VRN1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SmgcF6VRN1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
SmgcF6VRN1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SmgcF6VRN1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SmgcF6VRN1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SmgcF6VRN1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SmgcF6VRN1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SmgcF6VRN1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SmgcF6VRN1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SmgcF6VRN1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SmgcF6VRN1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SmgcF6VRN1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SmgcF6VRN1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SmgcF6VRN1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SmgcF6VRN1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SmgcF6VRN1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SmgcF6VRN1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SmgcF6VRN1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SmgcF6VRN1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SmgcF6VRN1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SmgcF6VRN1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SmgcF6VRN1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SmgcF6VRN1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SmgcF6VRN1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SmgcF6VRN1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SmgcF6VRN1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SmgcF6VRN1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SmgcF6VRN1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SmgcF6VRN1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SmgcF6VRN1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SmgcF6VRN1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SmgcF6VRN1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SmgcF6VRN1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SmgcF6VRN1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SmgcF6VRN1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SmgcF6VRN1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SmgcF6VRN1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SmgcF6VRN1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SmgcF6VRN1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SmgcF6VRN1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SmgcF6VRN1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SmgcF6VRN1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SmgcF6VRN1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SmgcF6VRN1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SmgcF6VRN1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SmgcF6VRN1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SmgcF6VRN1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SmgcF6VRN1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SmgcF6VRN1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SmgcF6VRN1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SmgcF6VRN1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SmgcF6VRN1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SmgcF6VRN1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SmgcF6VRN1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SmgcF6VRN1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SmgcF6VRN1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SmgcF6VRN1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SmgcF6VRN1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SmgcF6VRN1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SmgcF6VRN1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SmgcF6VRN1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SmgcF6VRN1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SmgcF6VRN1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SmgcF6VRN1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SmgcF6VRN1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SmgcF6VRN1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SmgcF6VRN1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SmgcF6VRN1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 262.2 ms