RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atpaf2Q91YY4 289 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nmnat1Q9EPA7 285 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 SgshQ9EQ08 502 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Drg2Q9QXB9 364 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Magel2Q9QZ04 1284 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm5689F6Y2A6 97 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pcdh9F8VPK8 1237 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Man2b1O09159 1013 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 SykP48025 629 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 CstaP56567 97 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 RnaselQ05921 735 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mylk3Q3UIZ8 795 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zrsr2Q62377 462 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Chsy1Q6ZQ11 800 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rps6ka6Q7TPS0 764 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Proser3Q7TSA6 634 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pdk1Q8BFP9 434 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc159Q8C963 411 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sik2Q8CFH6 931 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tfap2dQ91ZK0 452 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rec114Q9CWH4 259 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ola1Q9CZ30 396 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 PgcQ9D7R7 392 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tsga13Q9DA17 273 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Clec1bQ9JL99 229 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Igkv5-45A0A0B4J1J1 115 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tubb1A2AQ07 451 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccnb1P24860 430 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Irx1P81068 480 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mcm9Q2KHI9 1134 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nr1d1Q3UV55 615 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tdpoz3Q717B4 365 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam185aQ7TPD2 378 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Crb2Q80YA8 1282 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rprd1aQ8VDS4 312 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Msantd4Q91YU3 345 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Smc6Q924W5 1097 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lrp8Q924X6 996 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gpr37l1Q99JG2 481 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Xpo7Q9EPK7 1087 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dpysl5Q9EQF6 564 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Klrc2Q9WTJ9 238 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Phf2Q9WTU0 1096 aa12.14□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dnah12Q3V0Q1 3086 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn2r39L7N2E5 861 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Xbp1O35426 267 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 ShdO88834 343 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gap43P06837 227 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 PolgP54099 1218 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Irf7P70434 457 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Brms1lQ3U1T3 323 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Adad1Q5SUE7 619 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Itga3Q62470 1053 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mis18bp1Q80WQ8 998 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Baiap2l2Q80Y61 522 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Efcab8Q8C9R9 203 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ddx47Q9CWX9 455 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Polr3cQ9D483 533 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Map3k6Q9WTR2 1291 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc23a1Q9Z2J0 605 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm45861A0A1B0GRY3 1923 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam209A2APA5 170 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 4930558K02RikE0CXC6 182 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hmga1P17095 107 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ppp3ccP48455 513 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Flt3lgP49772 232 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rpl22P67984 128 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sec1P97353 368 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q6DFW0 481 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Orai2Q8BH10 250 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam204aQ8C6C7 236 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 CgasQ8C6L5 507 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pcdhb17Q91VD8 799 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lims2Q91XD2 341 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Grhl1Q921D9 618 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pex6Q99LC9 981 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ddx50Q99MJ9 734 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Raver1Q9CW46 748 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mgrn1Q9D074 532 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ppp1r12aQ9DBR7 1029 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 NfkbizQ9EST8 728 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atp11cQ9QZW0 1129 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Iqcj-Schip1A0A088MLT8 559 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn2r27D3YUK6 857 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Axin1O35625 863 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 P01878 344 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Camk4P08414 469 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Schip1P0DPB4 484 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 SftpbP50405 377 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Opa1P58281 960 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wbp2P97765 261 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm29609Q3UU56 907 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 KrtdapQ3V2T4 102 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Krt32Q62168 407 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 PdgfrlQ6PE55 375 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr698Q7TRN4 311 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dupd1Q8BK84 215 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gtf3c2Q8BL74 907 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nipal4Q8BZF2 406 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Crlf2Q8CII9 359 aa12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 41.9 ms