Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35,88■■■■□ 3,33
Irx1P81068 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,28
Irx1P81068 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
Irx1P81068 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,22■■■■□ 3,07
Irx1P81068 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■□□ 2,99
Irx1P81068 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33,18■■■□□ 2,9
Irx1P81068 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Irx1P81068 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,93■■■□□ 2,86
Irx1P81068 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,68■■■□□ 2,82
Irx1P81068 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Irx1P81068 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Irx1P81068 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32,18■■■□□ 2,74
Irx1P81068 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Irx1P81068 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31,75■■■□□ 2,67
Irx1P81068 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,74■■■□□ 2,67
Irx1P81068 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Irx1P81068 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,67
Irx1P81068 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31,64■■■□□ 2,66
Irx1P81068 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,3■■■□□ 2,6
Irx1P81068 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,59
Irx1P81068 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31,08■■■□□ 2,57
Irx1P81068 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Irx1P81068 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Irx1P81068 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Irx1P81068 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Irx1P81068 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Irx1P81068 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Irx1P81068 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Irx1P81068 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Irx1P81068 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,78■■■□□ 2,52
Irx1P81068 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Irx1P81068 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Irx1P81068 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Irx1P81068 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,59■■■□□ 2,49
Irx1P81068 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,58■■■□□ 2,49
Irx1P81068 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Irx1P81068 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Irx1P81068 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Irx1P81068 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Irx1P81068 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Irx1P81068 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,33■■■□□ 2,45
Irx1P81068 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Irx1P81068 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,08■■■□□ 2,41
Irx1P81068 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30,05■■■□□ 2,4
Irx1P81068 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Irx1P81068 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Irx1P81068 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Irx1P81068 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,02■■■□□ 2,4
Irx1P81068 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Irx1P81068 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Irx1P81068 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Irx1P81068 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Irx1P81068 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Irx1P81068 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,81■■■□□ 2,36
Irx1P81068 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Irx1P81068 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Irx1P81068 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29,57■■■□□ 2,32
Irx1P81068 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Irx1P81068 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Irx1P81068 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Irx1P81068 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Irx1P81068 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Irx1P81068 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Irx1P81068 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,3■■■□□ 2,28
Irx1P81068 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,26■■■□□ 2,27
Irx1P81068 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Irx1P81068 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Irx1P81068 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Irx1P81068 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Irx1P81068 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Irx1P81068 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Irx1P81068 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Irx1P81068 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Irx1P81068 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Irx1P81068 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Irx1P81068 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Irx1P81068 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Irx1P81068 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Irx1P81068 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Irx1P81068 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Irx1P81068 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,79■■■□□ 2,2
Irx1P81068 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Irx1P81068 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Irx1P81068 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Irx1P81068 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Irx1P81068 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Irx1P81068 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Irx1P81068 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Irx1P81068 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Irx1P81068 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Irx1P81068 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Irx1P81068 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Irx1P81068 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Irx1P81068 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Irx1P81068 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Irx1P81068 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
Irx1P81068 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Irx1P81068 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Irx1P81068 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Irx1P81068 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30,8 ms