Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Irx1P81068 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Irx1P81068 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Irx1P81068 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Irx1P81068 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Irx1P81068 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Irx1P81068 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Irx1P81068 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Irx1P81068 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Irx1P81068 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Irx1P81068 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Irx1P81068 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Irx1P81068 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Irx1P81068 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Irx1P81068 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Irx1P81068 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Irx1P81068 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Irx1P81068 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Irx1P81068 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Irx1P81068 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Irx1P81068 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Irx1P81068 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Irx1P81068 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Irx1P81068 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Irx1P81068 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Irx1P81068 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Irx1P81068 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Irx1P81068 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Irx1P81068 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Irx1P81068 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Irx1P81068 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Irx1P81068 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Irx1P81068 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Irx1P81068 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Irx1P81068 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Irx1P81068 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Irx1P81068 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Irx1P81068 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Irx1P81068 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Irx1P81068 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Irx1P81068 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Irx1P81068 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Irx1P81068 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Irx1P81068 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Irx1P81068 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Irx1P81068 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Irx1P81068 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Irx1P81068 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Irx1P81068 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Irx1P81068 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Irx1P81068 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Irx1P81068 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Irx1P81068 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Irx1P81068 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Irx1P81068 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Irx1P81068 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Irx1P81068 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Irx1P81068 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Irx1P81068 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Irx1P81068 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Irx1P81068 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Irx1P81068 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Irx1P81068 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Irx1P81068 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Irx1P81068 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Irx1P81068 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Irx1P81068 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Irx1P81068 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Irx1P81068 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Irx1P81068 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Irx1P81068 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Irx1P81068 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Irx1P81068 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Irx1P81068 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Irx1P81068 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Irx1P81068 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Irx1P81068 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Irx1P81068 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Irx1P81068 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Irx1P81068 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Irx1P81068 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Irx1P81068 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Irx1P81068 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Irx1P81068 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Irx1P81068 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Irx1P81068 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Irx1P81068 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Irx1P81068 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Irx1P81068 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Irx1P81068 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Irx1P81068 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Irx1P81068 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Irx1P81068 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Irx1P81068 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Irx1P81068 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Irx1P81068 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Irx1P81068 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Irx1P81068 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Irx1P81068 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Irx1P81068 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms