Protein–RNA interactions for Protein: Q62168

Krt32, Keratin, type I cuticular Ha2, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt32Q62168 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,91■■■■□ 3,66
Krt32Q62168 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,83■■■■□ 3,17
Krt32Q62168 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,82■■■■□ 3,16
Krt32Q62168 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
Krt32Q62168 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Krt32Q62168 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,67■■■□□ 2,98
Krt32Q62168 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33,61■■■□□ 2,97
Krt32Q62168 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,88■■■□□ 2,85
Krt32Q62168 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,59■■■□□ 2,81
Krt32Q62168 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Krt32Q62168 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Krt32Q62168 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,23■■■□□ 2,75
Krt32Q62168 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32■■■□□ 2,71
Krt32Q62168 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,71
Krt32Q62168 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
Krt32Q62168 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
Krt32Q62168 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,77■■■□□ 2,68
Krt32Q62168 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,67
Krt32Q62168 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Krt32Q62168 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Krt32Q62168 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Krt32Q62168 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Krt32Q62168 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Krt32Q62168 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Krt32Q62168 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Krt32Q62168 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Krt32Q62168 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,19■■■□□ 2,58
Krt32Q62168 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Krt32Q62168 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,57
Krt32Q62168 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Krt32Q62168 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,92■■■□□ 2,54
Krt32Q62168 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Krt32Q62168 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,84■■■□□ 2,53
Krt32Q62168 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,83■■■□□ 2,53
Krt32Q62168 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Krt32Q62168 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Krt32Q62168 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Krt32Q62168 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Krt32Q62168 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,33■■■□□ 2,45
Krt32Q62168 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Krt32Q62168 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30,14■■■□□ 2,42
Krt32Q62168 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Krt32Q62168 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Krt32Q62168 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,93■■■□□ 2,38
Krt32Q62168 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,9■■■□□ 2,38
Krt32Q62168 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Krt32Q62168 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Krt32Q62168 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,88■■■□□ 2,37
Krt32Q62168 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Krt32Q62168 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Krt32Q62168 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,76■■■□□ 2,35
Krt32Q62168 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Krt32Q62168 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Krt32Q62168 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,73■■■□□ 2,35
Krt32Q62168 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Krt32Q62168 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Krt32Q62168 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Krt32Q62168 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Krt32Q62168 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Krt32Q62168 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29,5■■■□□ 2,31
Krt32Q62168 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Krt32Q62168 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,4■■■□□ 2,3
Krt32Q62168 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29,39■■■□□ 2,3
Krt32Q62168 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Krt32Q62168 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,35■■■□□ 2,29
Krt32Q62168 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,33■■■□□ 2,29
Krt32Q62168 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Krt32Q62168 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Krt32Q62168 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Krt32Q62168 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,27■■■□□ 2,28
Krt32Q62168 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,18■■■□□ 2,26
Krt32Q62168 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Krt32Q62168 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,16■■■□□ 2,26
Krt32Q62168 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Krt32Q62168 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Krt32Q62168 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Krt32Q62168 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2,23
Krt32Q62168 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Krt32Q62168 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Krt32Q62168 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Krt32Q62168 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,82■■■□□ 2,2
Krt32Q62168 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Krt32Q62168 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Krt32Q62168 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Krt32Q62168 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,71■■■□□ 2,19
Krt32Q62168 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Krt32Q62168 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Krt32Q62168 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,64■■■□□ 2,18
Krt32Q62168 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,17
Krt32Q62168 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Krt32Q62168 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Krt32Q62168 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Krt32Q62168 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Krt32Q62168 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Krt32Q62168 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Krt32Q62168 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Krt32Q62168 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Krt32Q62168 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Krt32Q62168 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Krt32Q62168 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,5 ms