RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 RPL13P26373 211 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 GTF2H1P32780 548 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 TKTL1P51854 596 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 ZCWPW2Q504Y3 356 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa26.83■■□□□ 1.89
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CAPNS1-211ENST00000590874 SLCO6A1Q86UG4 719 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM124AQ86V42 546 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
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CAPNS1-211ENST00000590874 NUP58Q9BVL2 599 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC2A11Q9BYW1 496 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-211ENST00000590874 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa26.83■■□□□ 1.89
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CAPNS1-211ENST00000590874 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
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CAPNS1-211ENST00000590874 NDUFA8P51970 172 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
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CAPNS1-211ENST00000590874 EEF2KMTQ96G04 330 aa26.82■■□□□ 1.88
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CAPNS1-211ENST00000590874 ULBP1Q9BZM6 244 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 TM7SF3Q9NS93 570 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB20Q9NX57 234 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
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CAPNS1-211ENST00000590874 CER1O95813 267 aa26.81■■□□□ 1.88
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CAPNS1-211ENST00000590874 MATKP42679 507 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 MXI1P50539 228 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 HLA-BQ31612 363 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 PM20D1Q6GTS8 502 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 TTC39CQ8N584 583 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXL13Q8NEE6 735 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 TATDN2Q93075 761 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 TSPAN3O60637 253 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF883P0CG24 379 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 HLA-FP30511 346 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 ARID5AQ03989 594 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 E2F5Q15329 346 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 MPPE1Q53F39 396 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 FMNL3Q8IVF7 1028 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2T3Q8NH03 318 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATA32Q96LK8 384 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1B0GVT2 93 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 TIMM44O43615 452 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 PDE4CQ08493 712 aa26.79■■□□□ 1.88
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CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF366Q8N895 744 aa26.79■■□□□ 1.88
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CAPNS1-211ENST00000590874 LHX5Q9H2C1 402 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM245Q9H330 911 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 TOR4AQ9NXH8 423 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 GPSM3Q9Y4H4 160 aa26.79■■□□□ 1.88
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CAPNS1-211ENST00000590874 SLC8A3P57103 927 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 PCED1AQ9H1Q7 454 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 TSPAN16Q9UKR8 245 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 HARS2P49590 506 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 ADIGQ0VDE8 80 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 EDRF1Q3B7T1 1238 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 C19orf48Q6RUI8 117 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 DBX2Q6ZNG2 339 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 KRBA2Q6ZNG9 492 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 EDEM1Q92611 657 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 STOML2Q9UJZ1 356 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-211ENST00000590874 SGSHP51688 502 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 BCAT1P54687 386 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 PTPRNQ16849 979 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 CBWD6Q4V339 395 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 CBWD3Q5JTY5 395 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 CBWD5Q5RIA9 395 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 CHST9Q7L1S5 443 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 ADIPOR2Q86V24 386 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 MDM1Q8TC05 714 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC4Q9HBW1 653 aa26.76■■□□□ 1.87
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