RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	ABCB6	Q9NP58	842 aa		14.54	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		14.54	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		14.53	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	BECN2	A8MW95	431 aa		14.53	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	OLFM2	O95897	454 aa		14.53	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	14.53	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	PGF	P49763	221 aa		14.53	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	CETN1	Q12798	172 aa		14.53	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	KRT31	Q15323	416 aa		14.53	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	PTPRN	Q16849	979 aa		14.53	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	KIF19	Q2TAC6	998 aa		14.53	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	VWA3B	Q502W6	1294 aa		14.53	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		14.53	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		14.53	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		14.53	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	FAM171B	Q6P995	826 aa		14.53	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	LUZP1	Q86V48	1076 aa		14.53	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		14.53	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		14.53	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	BHMT	Q93088	406 aa		14.53	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		14.53	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		14.53	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		14.53	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	NDST4	Q9H3R1	872 aa		14.53	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	DEC1	Q9P2X7	70 aa		14.53	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	MGA	Q8IWI9	3026 aa		14.52	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		14.52	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222		F8VP50	259 aa		14.52	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	GABRD	O14764	452 aa		14.52	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	COCH	O43405	550 aa		14.52	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	ZNF217	O75362	1048 aa		14.52	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	TACC1	O75410	805 aa		14.52	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	FAM163B	P0C2L3	166 aa		14.52	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	ATP1A3	P13637	1013 aa		14.52	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	P4HA1	P13674	534 aa		14.52	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	CD6	P30203	668 aa		14.52	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	TNNC1	P63316	161 aa		14.52	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	CXADR	P78310	365 aa		14.52	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	CYP27A1	Q02318	531 aa		14.52	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	GAD2	Q05329	585 aa		14.52	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		14.52	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	LY6D	Q14210	128 aa		14.52	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		14.52	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		14.52	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		14.52	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	FAM124A	Q86V42	546 aa		14.52	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		14.52	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		14.52	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		14.52	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	LMO3	Q8TAP4	145 aa		14.52	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		14.52	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		14.52	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	MMS19	Q96T76	1030 aa		14.52	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	14.52	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		14.52	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		14.52	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	HLA-E	P13747	358 aa		14.51	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	ASPA	P45381	313 aa		14.51	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	DNAJC3	Q13217	504 aa		14.51	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	FUT11	Q495W5	492 aa		14.51	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		14.51	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		14.51	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		14.51	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		14.51	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		14.51	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		14.51	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	GABRG3	Q99928	467 aa		14.51	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	SYT15	Q9BQS2	421 aa		14.51	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		14.51	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	VPS16	Q9H269	839 aa		14.51	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		14.51	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		14.51	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	AK5	Q9Y6K8	562 aa		14.51	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		14.5	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	TMEM131	Q92545	1883 aa		14.5	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	14.5	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		14.5	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	CLDN5	O00501	218 aa		14.5	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	14.5	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	14.5	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	LHX1	P48742	406 aa		14.5	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	14.5	□□□□□ -0.09

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