RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 CD58P19256 250 aa20.87■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 MMP8P22894 467 aa20.87■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC1A1P43005 524 aa20.87■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 TNNC1P63316 161 aa20.87■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 MYO1EQ12965 1108 aa20.87■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 PLD1Q13393 1074 aa20.87■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 FSTL4Q6MZW2 842 aa20.87■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 BPIFB1Q8TDL5 484 aa20.87■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 HHIPQ96QV1 700 aa20.87■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 ADAM22Q9P0K1 906 aa20.87■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 KLK13Q9UKR3 277 aa20.87■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 CEP83Q9Y592 693 aa20.87■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 CPB1P15086 417 aa20.86■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 RAD23BP54727 409 aa20.86■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 MESDQ14696 234 aa20.86■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 PPP2R5EQ16537 467 aa20.86■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 ABCA7Q8IZY2 2146 aa20.86■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 APPL2Q8NEU8 664 aa20.86■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 SUSD3Q96L08 255 aa20.86■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 ZSWIM1Q9BR11 485 aa20.86■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 SDCBP2Q9H190 292 aa20.86■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF446Q9NWS9 450 aa20.86■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 EHD2Q9NZN4 543 aa20.86■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 EBF1Q9UH73 591 aa20.86■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 RNF40O75150 1001 aa20.85■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 CYP3A5P20815 502 aa20.85■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 COMTP21964 271 aa20.85■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 RRM1P23921 792 aa20.85■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 TNFRSF8P28908 595 aa20.85■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 WEE1P30291 646 aa20.85■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 PEX5P50542 639 aa20.85■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 EPHB3P54753 998 aa20.85■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 VSNL1P62760 191 aa20.85■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 UAP1L1Q3KQV9 507 aa20.85■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa20.85■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 PROSER1Q86XN7 944 aa20.85■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 WHAMMQ8TF30 809 aa20.85■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC32A1Q9H598 525 aa20.85■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 GPSM3Q9Y4H4 160 aa20.85■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa20.85■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 LOC400499M0QZD8 3231 aa20.85■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 LAMA5O15230 3695 aa20.85■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 VDRP11473 427 aa20.85■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 BRD2P25440 801 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 GBP1P32455 592 aa20.85■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 RPL9P32969 192 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 DNA2P51530 1060 aa20.85■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 GSCP56915 257 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 MAP9Q49MG5 647 aa20.85■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 GAREM2Q75VX8 874 aa20.85■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 PDZD3Q86UT5 571 aa20.85■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 C11orf74Q86VG3 221 aa20.85■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC4A11Q8NBS3 891 aa20.85■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 TFAP2BQ92481 460 aa20.85■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 TMEM176AQ96HP8 235 aa20.85■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 ATXN3LQ9H3M9 355 aa20.85■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 PARVAQ9NVD7 372 aa20.85■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa20.85■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 THADAQ6YHU6 1953 aa20.84■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 APBB3O95704 486 aa20.84■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 FGF19O95750 216 aa20.84■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 CAPNS1P04632 268 aa20.84■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 MAN1A1P33908 653 aa20.84■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 STILQ15468 1287 aa20.84■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa20.84■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 GPR158Q5T848 1215 aa20.84■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 DCAF12L1Q5VU92 463 aa20.84■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 PMS2CLQ68D20 193 aa20.84■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 C8orf74Q6P047 294 aa20.84■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 C11orf70Q9BRQ4 267 aa20.84■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 LRRC1Q9BTT6 524 aa20.84■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 SMYD3Q9H7B4 428 aa20.84■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM53CQ9NYF3 392 aa20.84■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 ANAPC7Q9UJX3 599 aa20.84■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 STRIP2Q9ULQ0 834 aa20.84■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 ASB3Q9Y575 518 aa20.84■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 FREM2Q5SZK8 3169 aa20.83■□□□□ 0.93
CTDSP2-204ENST00000548823 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa20.83■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM221BA6H8Z2 402 aa20.83■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 PATE3B3GLJ2 98 aa20.83■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 MYO1FO00160 1098 aa20.83■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 SPOPO43791 374 aa20.83■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 PROSCO94903 275 aa20.83■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 VNN2O95498 520 aa20.83■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 PRAMEF12O95522 483 aa20.83■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 EGFP01133 1207 aa20.83■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 PNPLA4P41247 253 aa20.83■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 ALDH1A3P47895 512 aa20.83■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 IRX4P78413 519 aa20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms