RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 CKBP12277 381 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 AMY2BP19961 511 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 EDNRBP24530 442 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 HPDP32754 393 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 UBA7P41226 1012 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 MXI1P50539 228 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 MTERF2Q49AM1 385 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 BTBD8Q5XKL5 378 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 SLC30A10Q6XR72 485 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 RASSF3Q86WH2 238 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 NLGN4XQ8N0W4 816 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 C3orf20Q8ND61 904 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 PRSS33Q8NF86 280 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 PCDH19Q8TAB3 1148 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 LZICQ8WZA0 190 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 C1orf74Q96LT6 269 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 GNRHR2Q96P88 292 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 LMF1Q96S06 567 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 MYO6Q9UM54 1294 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 C2CD2Q9Y426 696 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 INSL6Q9Y581 213 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 PTPDC1A2A3K4 754 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 GPAA1O43292 621 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 FOXS1O43638 330 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 MGEA5O60502 916 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 FSHBP01225 129 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 MMP3P08254 477 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 KRT13P13646 458 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 EPC2Q52LR7 807 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 TCEAL5Q5H9L2 206 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 FAM209AQ5JX71 171 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 TCTN3Q6NUS6 607 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 MFN1Q8IWA4 741 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 CEP57L1Q8IYX8 460 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 LINC00469Q8N7U9 141 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 KIF18AQ8NI77 898 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 KAT2BQ92831 832 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 HPS3Q969F9 1004 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 FBXW5Q969U6 566 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 SEMA4AQ9H3S1 761 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 PFDN2Q9UHV9 154 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 MUTYHQ9UIF7 546 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 DOCK5Q9H7D0 1870 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 KAT6AQ92794 2004 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 H3BNC9 293 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 SNX2O60749 519 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 YEATS4O95619 227 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 TXNP10599 105 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 IDO1P14902 403 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 MCM3P25205 808 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 ATP5DP30049 168 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 HSD17B7P56937 341 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 TFAP4Q01664 338 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 CCDC14Q49A88 953 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 Q4G0T1 1027 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 SPDYAQ5MJ70 313 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 PPP4R3AQ6IN85 833 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 CFAP161Q6P656 301 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 SYT10Q6XYQ8 523 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 IQCA1Q86XH1 822 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 CARNMT1Q8N4J0 409 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 EXOC2Q96KP1 924 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 CCDC114Q96M63 670 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 LRRC37BQ96QE4 947 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 CDC6Q99741 560 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 ZNF747Q9BV97 191 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 IL17RBQ9NRM6 502 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 CBLCQ9ULV8 474 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 STX8Q9UNK0 236 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 ZNF292O60281 2723 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 M0R2C6 588 aa8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms