RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518141.1

CPEB4-204, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, human

TSL 3

Gene CPEB4, Length 429 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPEB4-204	ENST00000518141	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	ACSM6	Q6P461	480 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	C14orf80	Q86SX3	495 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	RFX6	Q8HWS3	928 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	PELI3	Q8N2H9	469 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	GLMP	Q8WWB7	406 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	SLC25A28	Q96A46	364 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	VPS4A	Q9UN37	437 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	EMSY	Q7Z589	1322 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	EPN2	O95208	641 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	ATF3	P18847	181 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	FGFR2	P21802	821 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	SOX2	P48431	317 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	BFSP2	Q13515	415 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	ATP1A4	Q13733	1029 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	DGKH	Q86XP1	1220 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	ASB12	Q8WXK4	309 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	LRRC46	Q96FV0	321 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	SNX27	Q96L92	541 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	APOL5	Q9BWW9	433 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	TRIM2	Q9C040	744 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	SPTLC2	O15270	562 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	NDUFB8	O95169	186 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	T-ENOL	P0DO92	83 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	AKR1A1	P14550	325 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	PIK3CB	P42338	1070 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	GSTM5	P46439	218 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	PGGT1B	P53609	377 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	GAB1	Q13480	694 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	RFX8	Q6ZV50	586 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	LAS2	Q8IYD9	372 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	RNF152	Q8N8N0	203 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	FZD3	Q9NPG1	666 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141		A0A1W2PPC4	97 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	POM121B	A6NF01	834 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	UGDH	O60701	494 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	SLC8A1	P32418	973 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	AGTR2	P50052	363 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	CASP5	P51878	434 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	DMWD	Q09019	674 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	DLGAP5	Q15398	846 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	ELF2	Q15723	593 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	ISM2	Q6H9L7	571 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	FAM47B	Q8NA70	645 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	THSD1	Q9NS62	852 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	COG5	Q9UP83	839 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141		A0A0G2JK05	382 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	ATG13	O75143	517 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	VIP	P01282	170 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	TSHR	P16473	764 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPEB4-204	ENST00000518141	CDC25A	P30304	524 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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