RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509165.1

NFKB1-208, Transcript of nuclear factor kappa B subunit 1, human

TSL 5

Gene NFKB1, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFKB1-208	ENST00000509165	COL6A3	P12111	3177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	CEP290	O15078	2479 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	TPH1	P17752	444 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	GATM	P50440	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	CASP5	P51878	434 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	PGD	P52209	483 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	ZNF543	Q08ER8	600 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	GRM1	Q13255	1194 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	FHL3	Q13643	280 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	DAG1	Q14118	895 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	KCNAB1	Q14722	419 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	USP49	Q70CQ1	688 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	RNF152	Q8N8N0	203 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	SARG	Q9BW04	601 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	CIPC	Q9C0C6	399 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165		A0A087WZ62	844 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	PSMD9	O00233	223 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	EXOC3	O60645	756 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	INMT	O95050	263 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	IL18RAP	O95256	599 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	MCM5	P33992	734 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	LMAN2	Q12907	356 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	TONSL	Q96HA7	1378 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	EXOC5	O00471	708 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	CES2	O00748	559 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	CDK4	P11802	303 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	TRIM27	P14373	513 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	TSHR	P16473	764 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	NTSR1	P30989	418 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	HTR7	P34969	479 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	ABCG1	P45844	678 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	DIO1	P49895	249 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	STK3	Q13188	491 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	CEP78	Q5JTW2	689 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	FAM227B	Q96M60	508 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	ASB2	Q96Q27	587 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	MMS19	Q96T76	1030 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	ABCC6	O95255	1503 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	COL15A1	P39059	1388 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165		A0A0G2JLW4	131 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	CLCA1	A8K7I4	914 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165		A8MVJ9	347 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	APAF1	O14727	1248 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	MTHFS	P49914	203 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	COPA	P53621	1224 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	RNF44	Q7L0R7	432 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63

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