RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482844.5

CRBN-208, Transcript of cereblon, human

TSL 4

Gene CRBN, Length 653 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRBN-208	ENST00000482844	DNASE1L3	Q13609	305 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	RNF44	Q7L0R7	432 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	SRL	Q86TD4	932 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	MMP21	Q8N119	569 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	PELI3	Q8N2H9	469 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	PAF1	Q8N7H5	531 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	MARK4	Q96L34	752 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	COL15A1	P39059	1388 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	TULP3	O75386	442 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	INMT	O95050	263 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	ZBED1	O96006	694 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	TOMM40	O96008	361 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	MYL3	P08590	195 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	DRD1	P21728	446 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	TRAPPC10	P48553	1259 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	BFSP2	Q13515	415 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	CLCA4	Q14CN2	919 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	ASB5	Q8WWX0	329 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	LRRC46	Q96FV0	321 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	LYZL4	Q96KX0	146 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	MYD88	Q99836	296 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844		A0A087WZ62	844 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	UGDH	O60701	494 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	NDUFB8	O95169	186 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	HRG	P04196	525 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	CD63	P08962	238 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	FGF2	P09038	288 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	SETSIP	P0DME0	302 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	T-ENOL	P0DO92	83 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	CD53	P19397	219 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	KRT72	Q14CN4	511 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	ACOX1	Q15067	660 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	CNGA3	Q16281	694 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	LONRF1	Q17RB8	773 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	MANEA	Q5SRI9	462 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	MZT2A	Q6P582	158 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	FAM57B	Q71RH2	274 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	FAM227B	Q96M60	508 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	NLRP4	Q96MN2	994 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	CDC25A	P30304	524 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	HAL	P42357	657 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	FAM193A	P78312	1265 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	CPXCR1	Q8N123	301 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CRBN-208	ENST00000482844	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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