RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616558.4

SYTL1-210, Transcript of synaptotagmin like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYTL1, Length 1,878 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1-210ENST00000616558 I6L893 689 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 MSI1O43347 362 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 FGBP02675 491 aa20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 SOD2P04179 222 aa20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 TGM2P21980 687 aa20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 IVDP26440 423 aa20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 GBP1P32455 592 aa20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 GPS1Q13098 491 aa20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 ARL13BQ3SXY8 428 aa20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 VSIG1Q86XK7 387 aa20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 UNC45BQ8IWX7 931 aa20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 AUTS2Q8WXX7 1259 aa20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 CASP10Q92851 521 aa20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 ART4Q93070 314 aa20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 FBXO32Q969P5 355 aa20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 SLC9A7Q96T83 725 aa20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 VIPAS39Q9H9C1 493 aa20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 ETNK2Q9NVF9 386 aa20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 SPG21Q9NZD8 308 aa20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 WHRNQ9P202 907 aa20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 SNX10Q9Y5X0 201 aa20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 GREB1Q4ZG55 1949 aa20.12■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 FAM72CH0Y354 149 aa20.12■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 H3BRJ5 948 aa20.12■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 ITIH2P19823 946 aa20.12■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 YWHAQP27348 245 aa20.12■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 GGCXP38435 758 aa20.12■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 GLUD2P49448 558 aa20.12■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 NRLP54845 237 aa20.12■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 GBE1Q04446 702 aa20.12■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 FPGSQ05932 587 aa20.12■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 SMARCB1Q12824 385 aa20.12■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 FAM72AQ5TYM5 149 aa20.12■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 IZUMO3Q5VZ72 239 aa20.12■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 SLC8B1Q6J4K2 584 aa20.12■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 FAM72DQ6L9T8 149 aa20.12■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa20.12■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 MON1AQ86VX9 555 aa20.12■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 CCDC25Q86WR0 208 aa20.12■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 FAM72BQ86X60 149 aa20.12■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 C7orf61Q8IZ16 206 aa20.12■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 FAM71DQ8N9W8 422 aa20.12■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 ZBED2Q9BTP6 218 aa20.12■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 FAM53CQ9NYF3 392 aa20.12■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 ANAPC5Q9UJX4 755 aa20.12■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 GOLGA6BA6NDN3 693 aa20.11■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 SYN1P17600 705 aa20.11■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 CA8P35219 290 aa20.11■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 CXCR3P49682 368 aa20.11■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.818e-7■■■■□ 24.5
SYTL1-210ENST00000616558 TMC3Q7Z5M5 1100 aa20.11■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 KRT222Q8N1A0 295 aa20.11■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 NETO2Q8NC67 525 aa20.11■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 NTAN1Q96AB6 310 aa20.11■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 LRRC45Q96CN5 670 aa20.11■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 CLSTN3Q9BQT9 956 aa20.11■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 BACE2Q9Y5Z0 518 aa20.11■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 ZNF487B1APH4 448 aa20.11■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 CAPN2P17655 700 aa20.11■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 CFAP58Q5T655 872 aa20.11■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa20.11■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 VPS52Q8N1B4 723 aa20.11■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 ARHGEF4Q9NR80 690 aa20.11■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 TP73O15350 636 aa20.1■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 IRAK2O43187 625 aa20.1■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 ATF6P18850 670 aa20.1■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 HSD17B3P37058 310 aa20.1■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 TAF10Q12962 218 aa20.1■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 GPS2Q13227 327 aa20.1■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 MREGQ8N565 214 aa20.1■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 SMOC2Q9H3U7 446 aa20.1■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 IGLV3-25P01717 112 aa20.09■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 URODP06132 367 aa20.09■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 AIF1P55008 147 aa20.09■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 CBX1P83916 185 aa20.09■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 DSG1Q02413 1049 aa20.09■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 SCAPQ12770 1279 aa20.09■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 RFX8Q6ZV50 586 aa20.09■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 BEND5Q7L4P6 421 aa20.09■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 CCHCR1Q8TD31 782 aa20.09■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 SPATA17Q96L03 361 aa20.09■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 PWWP2AQ96N64 755 aa20.09■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 ZIM3Q96PE6 472 aa20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms