RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557295.1

LINC00640-204, long intergenic non-protein coding RNA 640, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00640, Length 708 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00640-204ENST00000557295 H0Y626 953 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 B3GAT3O94766 335 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 TRIM16O95361 564 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 SEC24AO95486 1093 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 TDP2O95551 362 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 IGHDP01880 384 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 JMJD7P0C870 316 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 CD8BP10966 210 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 TKTP29401 623 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 YWHABP31946 246 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 HK2P52789 917 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 CREB5Q02930 508 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 LSAMPQ13449 338 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 CAPSQ13938 189 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 KARSQ15046 597 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 PON2Q15165 354 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 NECTIN1Q15223 517 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 CREB3L3Q68CJ9 461 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 TPGS2Q68CL5 300 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 CD300LGQ6UXG3 332 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 CEP128Q6ZU80 1094 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 ELMOD1Q8N336 334 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 UBR7Q8N806 425 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 RCBTB1Q8NDN9 531 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 CCDC148Q8NFR7 591 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 TBCKQ8TEA7 893 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 UROC1Q96N76 676 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 C22orf23Q9BZE7 217 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 CYP4F11Q9HBI6 524 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 TRIM39Q9HCM9 518 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 ASAH2Q9NR71 780 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 PCMTD2Q9NV79 361 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 ERVK13-1Q9NX77 482 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 CEP72Q9P209 647 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 KLK13Q9UKR3 277 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 MAPRE3Q9UPY8 281 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 IGSF10Q6WRI0 2623 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 AKAP13Q12802 2813 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 RECQL4O94761 1208 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 RASGRP1O95267 797 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 MYL4P12829 197 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 LCP1P13796 627 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 ARL2P36404 184 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 NFKB2Q00653 900 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 PLCL1Q15111 1095 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 TEAD2Q15562 447 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 UPP1Q16831 310 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 COL28A1Q2UY09 1125 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 XKR9Q5GH70 373 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 TMEM196Q5HYL7 178 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 PKN3Q6P5Z2 889 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 C19orf48Q6RUI8 117 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 HAUS6Q7Z4H7 955 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 FGD2Q7Z6J4 655 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 C11orf74Q86VG3 221 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 DEFB124Q8NES8 71 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 MAP6Q96JE9 813 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 FAM20AQ96MK3 541 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 LRRC3BQ96PB8 259 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 TMEM209Q96SK2 561 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 LXNQ9BS40 222 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 CXCL16Q9H2A7 254 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 SLC32A1Q9H598 525 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 CATSPERZQ9NTU4 200 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 OBP2AQ9NY56 170 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 GTSE1Q9NYZ3 720 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 EBF1Q9UH73 591 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 MIA3Q5JRA6 1907 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 C7orf72A4D263 438 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 H7C4K7 107 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 I3L4J1 428 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 SYN3O14994 580 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 TBX3O15119 743 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 RAC2P15153 192 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 GJA1P17302 382 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 GLRA2P23416 452 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 CLCNKBP51801 687 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 CHRNEQ04844 493 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 CYP4F3Q08477 520 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 TWF1Q12792 350 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 LRP8Q14114 963 aa7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms