RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556007.6

TIMM9-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 9, human

TSL 3 BASIC

Gene TIMM9, Length 746 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM9-208	ENST00000556007	SLC39A13	Q96H72	371 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	OR2W5	A6NFC9	320 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	CD8B2	A6NJW9	211 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	TULP3	O75386	442 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	PSG1	P11464	419 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	MATN1	P21941	496 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	RPS6KB1	P23443	525 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	ATIC	P31939	592 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	CCKBR	P32239	447 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	IDUA	P35475	653 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	PBX1	P40424	430 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	UBE4A	Q14139	1066 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	DGKH	Q86XP1	1220 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	P3H2	Q8IVL5	708 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	MMP21	Q8N119	569 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	RNF152	Q8N8N0	203 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	MARK4	Q96L34	752 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	CHST12	Q9NRB3	414 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	TNFRSF1B	P20333	461 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	SCP2	P22307	547 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	MST1	P26927	711 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	CCKAR	P32238	428 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	HOXD12	P35452	270 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	PIK3CB	P42338	1070 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	CPA2	P48052	419 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	CASP5	P51878	434 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	SLC12A2	P55011	1212 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	ZNF543	Q08ER8	600 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	BIRC2	Q13490	618 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	FAM57B	Q71RH2	274 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	PIM3	Q86V86	326 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	SMC5	Q8IY18	1101 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	APOL5	Q9BWW9	433 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	CKAP5	Q14008	2032 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007		A0A1W2PPC4	97 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	PRY	O14603	147 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	CAND2	O75155	1236 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	COQ9	O75208	318 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	MYL4	P12829	197 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	TSHR	P16473	764 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	FGFR2	P21802	821 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	THBS3	P49746	956 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	GPS1	Q13098	491 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	CNGA3	Q16281	694 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	FAXC	Q5TGI0	409 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	GJA10	Q969M2	543 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TIMM9-208	ENST00000556007	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		4.33	□□□□□ -1.72
TIMM9-208	ENST00000556007	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		4.33	□□□□□ -1.72
TIMM9-208	ENST00000556007	TTC34	A8MYJ7	566 aa		4.33	□□□□□ -1.72
TIMM9-208	ENST00000556007	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		4.33	□□□□□ -1.72
TIMM9-208	ENST00000556007	MYL1	P05976	194 aa		4.33	□□□□□ -1.72
TIMM9-208	ENST00000556007	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.33	□□□□□ -1.72
TIMM9-208	ENST00000556007	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.33	□□□□□ -1.72
TIMM9-208	ENST00000556007	MMP8	P22894	467 aa		4.33	□□□□□ -1.72
TIMM9-208	ENST00000556007	NDUFS1	P28331	727 aa		4.33	□□□□□ -1.72
TIMM9-208	ENST00000556007	ZNF84	P51523	738 aa		4.33	□□□□□ -1.72
TIMM9-208	ENST00000556007	KLHL22	Q53GT1	634 aa		4.33	□□□□□ -1.72
TIMM9-208	ENST00000556007	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		4.33	□□□□□ -1.72
TIMM9-208	ENST00000556007	BEND5	Q7L4P6	421 aa		4.33	□□□□□ -1.72
TIMM9-208	ENST00000556007	RFX6	Q8HWS3	928 aa		4.33	□□□□□ -1.72
TIMM9-208	ENST00000556007	PIGK	Q92643	395 aa		4.33	□□□□□ -1.72
TIMM9-208	ENST00000556007	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	4.33	□□□□□ -1.72

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