RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547275.5

TPCN1-209, Transcript of two pore segment channel 1, humanhuman

TSL 4

Gene TPCN1, Length 564 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1-209ENST00000547275 IGLV3-27P01718 113 aa9.6□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 APOEP02649 317 aa9.6□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 F11P03951 625 aa9.6□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 C8AP07357 584 aa9.6□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 SRGAP2BP0DMP2 458 aa9.6□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 TCF3P15923 654 aa9.6□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 RPL17P18621 184 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 RABGGTBP53611 331 aa9.6□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 CDH6P55285 790 aa9.6□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 TWF1Q12792 350 aa9.6□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 KRT81Q14533 505 aa9.6□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 LRIT3Q3SXY7 679 aa9.6□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 PPM1LQ5SGD2 360 aa9.6□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 SLC9A4Q6AI14 798 aa9.6□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 HFE2Q6ZVN8 426 aa9.6□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 CCDC50Q8IVM0 306 aa9.6□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 TSC1Q92574 1164 aa9.6□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 PLD4Q96BZ4 506 aa9.6□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 GCNAQ96QF7 691 aa9.6□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 EPAS1Q99814 870 aa9.6□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 PRO3102Q9H379 93 aa9.6□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 FAM204AQ9H8W3 233 aa9.6□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 NMUR1Q9HB89 426 aa9.6□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 MARCH2Q9P0N8 246 aa9.6□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 PCSK1NQ9UHG2 260 aa9.6□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 RASAL2Q9UJF2 1139 aa9.6□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 AP4E1Q9UPM8 1137 aa9.6□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 PLXNA3P51805 1871 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 KIAA1671Q9BY89 1806 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 WASH4PA8MWX3 477 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 HACD1B0YJ81 288 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 GRM6O15303 877 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 PHF2O75151 1096 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 GAS8O95995 478 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 OAS1P00973 400 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 KRT1P04264 644 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 ITGAVP06756 1048 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 IL4RP24394 825 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 DNAJB2P25686 324 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 HOXC13P31276 330 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 SERPINB6P35237 376 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 HARS2P49590 506 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 TBX4P57082 545 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 USP46P62068 366 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 SLC7A9P82251 487 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 SEMA3BQ13214 749 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 DPYSL3Q14195 570 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 CDO1Q16878 200 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 C5orf22Q49AR2 442 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 PPP2R2DQ66LE6 453 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 WDR93Q6P2C0 686 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 MFSD7Q6UXD7 560 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 BBOF1Q8ND07 529 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 RAPGEF5Q92565 580 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 CASP10Q92851 521 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 RNF34Q969K3 372 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 CAPZA3Q96KX2 299 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 LRRC3Q9BY71 257 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 PRKD2Q9BZL6 878 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 TKTL2Q9H0I9 626 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 RAB17Q9H0T7 212 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 TSPYL1Q9H0U9 437 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 TLE6Q9H808 572 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 PCDH18Q9HCL0 1135 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 ASAH2Q9NR71 780 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 PIGVQ9NUD9 493 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 GMIPQ9P107 970 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 OR12D3Q9UGF7 316 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 STOML2Q9UJZ1 356 aa9.59□□□□□ -0.87
TPCN1-209ENST00000547275 CEP290O15078 2479 aa9.58□□□□□ -0.88
TPCN1-209ENST00000547275 HIDE1A8MVS5 230 aa9.58□□□□□ -0.88
TPCN1-209ENST00000547275 DYNC1I1O14576 645 aa9.58□□□□□ -0.88
TPCN1-209ENST00000547275 MTSS1O43312 755 aa9.58□□□□□ -0.88
TPCN1-209ENST00000547275 CST8O60676 142 aa9.58□□□□□ -0.88
TPCN1-209ENST00000547275 MX2P20592 715 aa9.58□□□□□ -0.88
TPCN1-209ENST00000547275 DNAJB1P25685 340 aa9.58□□□□□ -0.88
TPCN1-209ENST00000547275 MARCKSL1P49006 195 aa9.58□□□□□ -0.88
TPCN1-209ENST00000547275 SLC11A2P49281 568 aa9.58□□□□□ -0.88
TPCN1-209ENST00000547275 NME3Q13232 169 aa9.58□□□□□ -0.88
TPCN1-209ENST00000547275 KCNC3Q14003 757 aa9.58□□□□□ -0.88
TPCN1-209ENST00000547275 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TPCN1-209ENST00000547275 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
TPCN1-209ENST00000547275 DUSP6Q16828 381 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms