RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504263.1

PCAT4-201, prostate cancer associated transcript 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCAT4, Length 2,091 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCAT4-201ENST00000504263 C8orf4Q9NR00 106 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 KBTBD4Q9NVX7 518 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 GDAP2Q9NXN4 497 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TAS2R7Q9NYW3 318 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 NPAP1Q9NZP6 1156 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TMOD2Q9NZR1 351 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ASIC3Q9UHC3 531 aa3.63□□□□□ -1.83
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PCAT4-201ENST00000504263 APPL1Q9UKG1 709 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 AMFRQ9UKV5 643 aa3.63□□□□□ -1.83
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PCAT4-201ENST00000504263 MKL2Q9ULH7 1088 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 SOX13Q9UN79 622 aa3.63□□□□□ -1.83
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PCAT4-201ENST00000504263 SLC8A2Q9UPR5 921 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 GDAQ9Y2T3 454 aa3.63□□□□□ -1.83
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PCAT4-201ENST00000504263 AP4B1Q9Y6B7 739 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ZHX2Q9Y6X8 837 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 EMSYQ7Z589 1322 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa3.63□□□□□ -1.83
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PCAT4-201ENST00000504263 A0A087X0T9 212 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 A0A0B4J203 849 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TRIM49BA6NDI0 452 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 LRRIQ4A6NIV6 560 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 VWA5AO00534 786 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 EPHB6O15197 1021 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TM9SF1O15321 606 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ZW10O43264 779 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ZBTB43O43298 467 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TYROBPO43914 113 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 GMNNO75496 209 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 MAP3K6O95382 1288 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 DLDP09622 509 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 POLR2MP0CAP2 368 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 KRT3P12035 628 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 KRT5P13647 590 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 PRKACAP17612 351 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 FGFR4P22455 802 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 BMPR1AP36894 532 aa3.63□□□□□ -1.83
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PCAT4-201ENST00000504263 SLC26A3P40879 764 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 PRELPP51888 382 aa3.63□□□□□ -1.83
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PCAT4-201ENST00000504263 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 LAPTM5Q13571 262 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 HIC1Q14526 733 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF846Q147U1 533 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TRIP10Q15642 601 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 AMHR2Q16671 573 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 C5orf22Q49AR2 442 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TNNI3KQ59H18 835 aa3.63□□□□□ -1.83
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PCAT4-201ENST00000504263 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 SHEQ5VZ18 495 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 OGFOD2Q6N063 350 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ERAP2Q6P179 960 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 FAM117BQ6P1L5 589 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 GADL1Q6ZQY3 521 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 PRUNE1Q86TP1 453 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TRIM22Q8IYM9 498 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 SYNE4Q8N205 404 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 PQLC1Q8N2U9 271 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 SLC4A11Q8NBS3 891 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 LHFPL5Q8TAF8 219 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 HELQQ8TDG4 1101 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 EPS8L1Q8TE68 723 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 S100ZQ8WXG8 99 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ASIC4Q96FT7 647 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 FAM20AQ96MK3 541 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 UROC1Q96N76 676 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 MTMR9Q96QG7 549 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 COQ7Q99807 217 aa3.63□□□□□ -1.83
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