RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 PATE3B3GLJ2 98 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXB3-211ENST00000490677 BRD2P25440 801 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
HOXB3-211ENST00000490677 GEN1Q17RS7 908 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXB3-211ENST00000490677 FMNL3Q8IVF7 1028 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXB3-211ENST00000490677 CHPFQ8IZ52 775 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXB3-211ENST00000490677 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
HOXB3-211ENST00000490677 EDEM1Q92611 657 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXB3-211ENST00000490677 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
HOXB3-211ENST00000490677 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXB3-211ENST00000490677 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP29.09■■■□□ 2.25
HOXB3-211ENST00000490677 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXB3-211ENST00000490677 STRIP2Q9ULQ0 834 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXB3-211ENST00000490677 PCDH15Q96QU1 1955 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXB3-211ENST00000490677 TPRP12270 2363 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
HOXB3-211ENST00000490677 WASH3PC4AMC7 463 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXB3-211ENST00000490677 PTGER3P43115 390 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXB3-211ENST00000490677 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
HOXB3-211ENST00000490677 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXB3-211ENST00000490677 STOML2Q9UJZ1 356 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXB3-211ENST00000490677 RAD54BQ9Y620 910 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXB3-211ENST00000490677 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 GNA14O95837 355 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 ADRB1P08588 477 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 NDUFV2P19404 249 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 RGS7P49802 495 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 ENPP2Q13822 863 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 MSANTD2Q6P1R3 559 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 TMEFF1Q8IYR6 380 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 TRIML1Q8N9V2 468 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 SPACA7Q96KW9 195 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 AFPP02771 609 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 LCP1P13796 627 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 RPL34P49207 117 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 CYP2U1Q7Z449 544 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 PGBD3Q8N328 593 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 CLEC4CQ8WTT0 213 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 EDEM2Q9BV94 578 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 ABCC13Q9NSE7 274 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM74BQ9NUR3 256 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 KIAA1468Q9P260 1216 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 M0QYV0 167 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 PIK3R2O00459 728 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 MSI1O43347 362 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 IGLV3-27P01718 113 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 CETN1Q12798 172 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 STILQ15468 1287 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 SPDYCQ5MJ68 293 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM215Q68D42 235 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 LPCAT2Q7L5N7 544 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 ERLEC1Q96DZ1 483 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 SLC6A17Q9H1V8 727 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 CD93Q9NPY3 652 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP29.05■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 UBE2HP62256 183 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 RNF43Q68DV7 783 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 IL31Q6EBC2 164 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 IRGQQ8WZA9 623 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 STON1Q9Y6Q2 735 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 ACACBO00763 2458 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 CACNA1EQ15878 2313 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 FYNP06241 537 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 IRX4P78413 519 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 ARMCX6Q7L4S7 300 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 IRF2BP1Q8IU81 584 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 RNF139Q8WU17 664 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 PIGKQ92643 395 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 MRGPRX1Q96LB2 322 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 HSFY1Q96LI6 401 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 RWDD2AQ9UIY3 292 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 IL12RB1P42701 662 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 GPD2P43304 727 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 CAMK4Q16566 473 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 SDE2Q6IQ49 451 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 SLC2A11Q9BYW1 496 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 PILRBQ9UKJ0 227 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 CHD8Q9HCK8 2581 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXB3-211ENST00000490677 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
HOXB3-211ENST00000490677 MAP3K13O43283 966 aa29.01■■■□□ 2.23
HOXB3-211ENST00000490677 LATS1O95835 1130 aa29.01■■■□□ 2.23
HOXB3-211ENST00000490677 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa29.01■■■□□ 2.23
HOXB3-211ENST00000490677 DDI1Q8WTU0 396 aa29.01■■■□□ 2.23
HOXB3-211ENST00000490677 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
HOXB3-211ENST00000490677 C4orf47A7E2U8 309 aa29■■■□□ 2.23
HOXB3-211ENST00000490677 LTFP02788 710 aa29■■■□□ 2.23
HOXB3-211ENST00000490677 CYBBP04839 570 aa29■■■□□ 2.23
HOXB3-211ENST00000490677 ITPKAP23677 461 aa29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms