RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489853.1

SNRNP40-206, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 40, human

TSL 2

Gene SNRNP40, Length 1,928 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNRNP40-206	ENST00000489853	C1orf50	Q9BV19	199 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	MXD3	Q9BW11	206 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	C12orf49	Q9H741	205 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	DSE	Q9UL01	958 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	PPME1	Q9Y570	386 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	MYH3	P11055	1940 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	SYCE1L	A8MT33	242 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853		I3L4J1	428 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853		J3QL48	77 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	GIPC1	O14908	333 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	GUCY1B2	O75343	617 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	TNFRSF21	O75509	655 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	MYO1D	O94832	1006 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ALX3	O95076	343 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	FKBP9	O95302	570 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	CRYZL1	O95825	349 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	USP17L7	P0C7H9	530 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	SLC1A1	P43005	524 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	MARCKSL1	P49006	195 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ADAM17	P78536	824 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	SLC25A3	Q00325	362 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	COASY	Q13057	564 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	SELENBP1	Q13228	472 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	PTK2B	Q14289	1009 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ATG16L1	Q676U5	607 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ZNF790	Q6PG37	636 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	XKR5	Q6UX68	686 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	SLC15A4	Q8N697	577 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	HSPH1	Q92598	858 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	WNK4	Q96J92	1243 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	SPATA17	Q96L03	361 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	PWWP2A	Q96N64	755 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	WRNIP1	Q96S55	665 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	KCNK16	Q96T55	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	MARCH7	Q9H992	704 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ARMT1	Q9H993	441 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	OLAH	Q9NV23	265 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	EBF1	Q9UH73	591 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	CDH22	Q9UJ99	828 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	CPQ	Q9Y646	472 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	CHD4	Q14839	1912 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ILVBL	A1L0T0	632 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	FAM172BP	A6NC97	362 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ZNF839	A8K0R7	811 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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