RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467435.1

HDLBP-231, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-231	ENST00000467435	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	CARNS1	A5YM72	827 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	ZBBX	A8MT70	800 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435		H3BQF6	201 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435		H7C0C1	242 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	NDC80	O14777	642 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	ADAM12	O43184	909 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	IRAK2	O43187	625 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	CREB3	O43889	395 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	IFNB1	P01574	187 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	AMPD1	P23109	780 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	ADRA1B	P35368	520 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	HSD17B3	P37058	310 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	ATP5O	P48047	213 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	GLUD2	P49448	558 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	CXCR3	P49682	368 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	USP46	P62068	366 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	12.75	□□□□□ -0.37	9e-8	■□□□□ 9
HDLBP-231	ENST00000467435	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	P3H1	Q32P28	736 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	ALS2CL	Q60I27	953 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	FBXO32	Q969P5	355 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	ZBTB9	Q96C00	473 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	ZIM3	Q96PE6	472 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	YME1L1	Q96TA2	773 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	WDCP	Q9H6R7	721 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	NMUR1	Q9HB89	426 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	GMIP	Q9P107	970 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	CFAP69	A5D8W1	941 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	C2CD2L	O14523	706 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	TP73	O15350	636 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	MFSD11	O43934	449 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	YWHAQ	P27348	245 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	GGCX	P38435	758 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	PGF	P49763	221 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	PMS2	P54278	862 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	TPI1	P60174	286 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	GBE1	Q04446	702 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	GPS1	Q13098	491 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	DUSP4	Q13115	394 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	DPYS	Q14117	519 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	MON1A	Q86VX9	555 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	GPR152	Q8TDT2	470 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	CASP10	Q92851	521 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	RNF34	Q969K3	372 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	SPATA17	Q96L03	361 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	MED4	Q9NPJ6	270 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	COMMD8	Q9NX08	183 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	SPG21	Q9NZD8	308 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	IL37	Q9NZH6	218 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	OBSL1	O75147	1896 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM92A	A1XBS5	289 aa		12.73	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435		I6L893	689 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	AGPS	O00116	658 aa		12.73	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	MAP3K6	O95382	1288 aa		12.73	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	UROD	P06132	367 aa		12.73	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	ATF6	P18850	670 aa		12.73	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	OR1D2	P34982	312 aa		12.73	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	CHKA	P35790	457 aa		12.73	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	NR2C2	P49116	596 aa		12.73	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	DSG1	Q02413	1049 aa		12.73	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	FPGS	Q05932	587 aa		12.73	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	SEMA3B	Q13214	749 aa		12.73	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	XRCC4	Q13426	336 aa		12.73	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	SLMAP	Q14BN4	828 aa		12.73	□□□□□ -0.37
HDLBP-231	ENST00000467435	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		12.73	□□□□□ -0.37

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