RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa15.86■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 TULP2O00295 520 aa15.85■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 KCNK5O95279 499 aa15.85■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 CD44P16070 742 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 MFAP3P55082 362 aa15.85■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 IRX4P78413 519 aa15.85■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 MPPE1Q53F39 396 aa15.85■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 BSPRYQ5W0U4 402 aa15.85■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 TTI2Q6NXR4 508 aa15.85■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa15.85■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 FMNL3Q8IVF7 1028 aa15.85■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 SCML4Q8N228 414 aa15.85■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 UBR7Q8N806 425 aa15.85■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 GOLGA1Q92805 767 aa15.85■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa15.85■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa15.85■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 THADAQ6YHU6 1953 aa15.85■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 PATE3B3GLJ2 98 aa15.84■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 TIMM44O43615 452 aa15.84■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 NDUFS2O75306 463 aa15.84■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 LCP1P13796 627 aa15.84■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 NDUFV2P19404 249 aa15.84■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 GCNT1Q02742 428 aa15.84■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 ARID5AQ03989 594 aa15.84■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 ZNF33AQ06730 810 aa15.84■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 CNGA2Q16280 664 aa15.84■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 KIAA1211LQ6NV74 962 aa15.84■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 IRGQQ8WZA9 623 aa15.84■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 EDEM1Q92611 657 aa15.84■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa15.84■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 CYP8B1Q9UNU6 501 aa15.84■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 STON1Q9Y6Q2 735 aa15.84■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 YJEFN3A6XGL0 299 aa15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 E7ENQ6 273 aa15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 M0QYV0 167 aa15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 LATS1O95835 1130 aa15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 CFIP05156 583 aa15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 ITPKAP23677 461 aa15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 DAOAP59103 153 aa15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 PAK1Q13153 545 aa15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 MORC3Q14149 939 aa15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 GEN1Q17RS7 908 aa15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 DUOXA1Q1HG43 343 aa15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 PKDCCQ504Y2 493 aa15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 SLC23A3Q6PIS1 610 aa15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 FAM217AQ8IXS0 508 aa15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 EHBP1Q8NDI1 1231 aa15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 SLC35F5Q8WV83 523 aa15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 FOXJ1Q92949 421 aa15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 MRGPRX1Q96LB2 322 aa15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 HSFY1Q96LI6 401 aa15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 CIPCQ9C0C6 399 aa15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 CD248Q9HCU0 757 aa15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 TMEM74BQ9NUR3 256 aa15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 ELOVL2Q9NXB9 296 aa15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 PILRBQ9UKJ0 227 aa15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 SLC6A14Q9UN76 642 aa15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 CTNND2Q9UQB3 1225 aa15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 RAD54BQ9Y620 910 aa15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 TPRP12270 2363 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 WASH3PC4AMC7 463 aa15.82■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 BIN1O00499 593 aa15.82■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 FBXO21O94952 628 aa15.82■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 AFPP02771 609 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 KCNH2Q12809 1159 aa15.82■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 UAP1L1Q3KQV9 507 aa15.82■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 SYCP2LQ5T4T6 812 aa15.82■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 ADGRF1Q5T601 910 aa15.82■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 BHLHA9Q7RTU4 235 aa15.82■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 UNC45BQ8IWX7 931 aa15.82■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 TFAP2BQ92481 460 aa15.82■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 ERLEC1Q96DZ1 483 aa15.82■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms