RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384479.1

RNU6-790P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 790, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-790P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-790P-201ENST00000384479 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 ERVK-5Q9HDB9 667 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 HELLSQ9NRZ9 838 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 PHTF1Q9UMS5 762 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 FAM50BQ9Y247 325 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 SOCS2O14508 198 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 PLA2G6O60733 806 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 KRT18P05783 430 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 TMEM191BP0C7N4 346 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 RPS6KB1P23443 525 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 ARHGAP25P42331 645 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZNF84P51523 738 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 RAE1P78406 368 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 ID2Q02363 134 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 BTKQ06187 659 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 MAPK7Q13164 816 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 SEMA3BQ13214 749 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 CNGA3Q16281 694 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 MPEG1Q2M385 716 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 Q4G0T1 1027 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 AWAT1Q58HT5 328 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 TMEM196Q5HYL7 178 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 LAS2Q8IYD9 372 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 DEPTORQ8TB45 409 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 ASB12Q8WXK4 309 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 RSC1A1Q92681 617 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 GJA10Q969M2 543 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 HMCESQ96FZ2 354 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 VCPIP1Q96JH7 1222 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZFYVE19Q96K21 471 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 SGCZQ96LD1 299 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 SENP7Q9BQF6 1050 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 CDCP1Q9H5V8 836 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 SLC52A1Q9NWF4 448 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZNF521Q96K83 1311 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 CCDC187A0A096LP49 1063 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 FAM234BA2RU67 622 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 C16orf96A6NNT2 1141 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 TTC34A8MYJ7 566 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 PRYO14603 147 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 RRHO14718 337 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 INPPL1O15357 1258 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 NCK2O43639 380 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 NDST3O95803 873 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 PLAUP00749 431 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 CD63P08962 238 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 HARSP12081 509 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 IGFBP2P18065 325 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 NDUFS1P28331 727 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 HSPA7P48741 367 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 SLC12A2P55011 1212 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 B4GALNT1Q00973 533 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 DMWDQ09019 674 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 PICALMQ13492 652 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 GLCCI1Q86VQ1 547 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 RFX6Q8HWS3 928 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 P3H2Q8IVL5 708 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 SVIPQ8NHG7 77 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 PMM1Q92871 262 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 CCDC138Q96M89 665 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 FCRL5Q96RD9 977 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 MYD88Q99836 296 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 TRMOQ9BU70 441 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 TM2D2Q9BX73 214 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 GJB4Q9NTQ9 266 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 MTMR4Q9NYA4 1195 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 ELOVL5Q9NYP7 299 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 NFU1Q9UMS0 254 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 C2CD4BA6NLJ0 364 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 PODXLO00592 558 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 PCDH17O14917 1159 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 NPC1O15118 1278 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 ITGA5P08648 1049 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 PRF1P14222 555 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 TFEBP19484 476 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 IDUAP35475 653 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 GSTM5P46439 218 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 SOX2P48431 317 aa3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms