RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 TBX22Q9Y458 520 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 PEX16Q9Y5Y5 336 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 TULP4Q9NRJ4 1543 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 BCORL1Q5H9F3 1711 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 ZBTB22O15209 634 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 TNFRSF21O75509 655 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 ANPEPP15144 967 aa5.66□□□□□ -1.5
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PTPRB-202ENST00000334414 CLEC4GQ6UXB4 293 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 OTOAQ7RTW8 1153 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 EPHX4Q8IUS5 362 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 KCNB2Q92953 911 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 GMIPQ9P107 970 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa5.66□□□□□ -1.5
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PTPRB-202ENST00000334414 MYO1HQ8N1T3 1032 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 NEDD4LQ96PU5 975 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 NIF3L1Q9GZT8 377 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 PDGFCQ9NRA1 345 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 CLCA2Q9UQC9 943 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 ERCC2P18074 760 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF844Q08AG5 666 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
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PTPRB-202ENST00000334414 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 HAUS6Q7Z4H7 955 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 ADCY4Q8NFM4 1077 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 NDNQ99608 321 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 PCDHA6Q9UN73 950 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 CDK8P49336 464 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 TTLL4Q14679 1199 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 PID1Q7Z2X4 250 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 RAB43Q86YS6 212 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 OR52L1Q8NGH7 329 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 HELQQ8TDG4 1101 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 LATS2Q9NRM7 1088 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 ZSWIM5Q9P217 1185 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 DHFRP00374 187 aa5.66□□□□□ -1.5
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PTPRB-202ENST00000334414 MAPK9P45984 424 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 TCP10Q12799 353 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 GALNT3Q14435 633 aa5.66□□□□□ -1.5
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PTPRB-202ENST00000334414 INSCQ1MX18 579 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 ACMSDQ8TDX5 336 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 ANAPC2Q9UJX6 822 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 TULP2O00295 520 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 PAX3P23760 479 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 PIK3CBP42338 1070 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 RENBPP51606 427 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 CASP5P51878 434 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 CCNG1P51959 295 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 CDH4P55283 916 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 PTPRNQ16849 979 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 EPC2Q52LR7 807 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 OR2W6PQ8NHA6 318 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 CNKSR1Q969H4 720 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 SLC38A2Q96QD8 506 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 TBC1D13Q9NVG8 400 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 LARGE1O95461 756 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 MTERF2Q49AM1 385 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 TCEAL5Q5H9L2 206 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 UNC5CLQ8IV45 518 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF507Q8TCN5 953 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 FAM213AQ9BRX8 229 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF112Q9UJU3 913 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 SLC39A10Q9ULF5 831 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 HOXC6P09630 235 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 COMTP21964 271 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 PRDX6P30041 224 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 LRRC24Q50LG9 513 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 LCN1P1Q5VSP4 162 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 RTKNQ9BST9 563 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 HOXC10Q9NYD6 342 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 DNAJB4Q9UDY4 337 aa5.65□□□□□ -1.5
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