RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000040089.4

Rnf43-201, Transcript of E3 ubiquitin-protein ligase RNF43, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Rnf43, Length 3,670 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Prpf38bQ80SY5 542 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Gtf3c2Q8BL74 907 aa9.6□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Ssh3Q8K330 649 aa9.6□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Appl1Q8K3H0 707 aa9.6□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Tcirg1Q9JHF5 834 aa9.6□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 PnkpQ9JLV6 522 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Hic1Q9R1Y5 733 aa9.6□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Zswim8Q3UHH1 1832 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Rnf19bA2A7Q9 732 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Atp8b4A2ANX3 1194 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Gm379J3QQ19 296 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Gm3138K7N754 218 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Per1O35973 1291 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Odc1P00860 461 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 PdgfaP20033 211 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 PuraP42669 321 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Sash1P59808 1230 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 CkbQ04447 381 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Serac1Q3U213 654 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 RbakQ8BQC8 711 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Q8CCC3 530 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Dnajc9Q91WN1 259 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Ergic2Q9CR89 377 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Nt5c3aQ9D020 331 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Kif12Q9D2Z8 642 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Tmem68Q9D850 329 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Eif4e3Q9DBB5 207 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Slc12a4Q9JIS8 1085 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 TfgQ9Z1A1 397 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Speer3W4VSP1 261 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Gm28043E0CXC2 719 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Clca3bE9PUL3 1044 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Vmn2r100E9QAZ9 850 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Gm3739L7N296 216 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Serpini1O35684 410 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 AlbP07724 608 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Fgfr1P16092 822 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Tmed1Q3V009 227 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Pdp2Q504M2 532 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 CochQ62507 552 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Cpa4Q6P8K8 420 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Ccdc154Q6RUT8 657 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Usp8Q80U87 1080 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Vmn2r43Q80Z08 845 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 CenpuQ8C4M7 410 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Gtpbp10Q8K013 366 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Olfr356Q8VFP5 315 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 St13Q99L47 371 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Pin4Q9CWW6 131 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Gtf3c6Q9D8P7 227 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Htra2Q9JIY5 458 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 RptorQ8K4Q0 1335 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Vwa5b1A9Z1V5 1215 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Atf6F6VAN0 656 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Capn6O35646 641 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Cdh16O88338 830 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Dync1i2O88487 612 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 AcrP23578 436 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Ripk2P58801 539 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Cyp2c65Q148B1 490 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Togaram2Q3TYG6 1002 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 PighQ5M9N4 188 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Uimc1Q5U5Q9 727 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Nfe2l2Q60795 597 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Has1Q61647 583 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Mapk15Q80Y86 549 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Pak4Q8BTW9 593 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Tgif2lx2Q8K5B9 231 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 B3galt6Q91Z92 325 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Ophn1Q99J31 802 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Taf7lQ9D3R9 471 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Terb2Q9D494 218 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Atad1Q9D5T0 361 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Ndufa13Q9ERS2 144 aa9.59□□□□□ -0.87
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Znf536Q8K083 1302 aa9.58□□□□□ -0.88
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Plch1Q4KWH5 1682 aa9.58□□□□□ -0.88
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Lipo2D3YY49 398 aa9.58□□□□□ -0.88
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Vmn2r19G5E8G4 854 aa9.58□□□□□ -0.88
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Impa1O55023 277 aa9.58□□□□□ -0.88
Rnf43-201ENSMUST00000040089 AmhP27106 555 aa9.58□□□□□ -0.88
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Gjb3P28231 270 aa9.58□□□□□ -0.88
Rnf43-201ENSMUST00000040089 FerP70451 823 aa9.58□□□□□ -0.88
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Msx2Q03358 267 aa9.58□□□□□ -0.88
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Tcf4Q60722 670 aa9.58□□□□□ -0.88
Rnf43-201ENSMUST00000040089 PostnQ62009 838 aa9.58□□□□□ -0.88
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Sh3rf1Q69ZI1 892 aa9.58□□□□□ -0.88
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Frmd5Q6P5H6 517 aa9.58□□□□□ -0.88
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Tdpoz3Q717B4 365 aa9.58□□□□□ -0.88
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Iars2Q8BIJ6 1012 aa9.58□□□□□ -0.88
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Slc9a9Q8BZ00 644 aa9.58□□□□□ -0.88
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Adnp2Q8CHC8 1165 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Rftn2Q8CHX7 500 aa9.58□□□□□ -0.88
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Tfap2dQ91ZK0 452 aa9.58□□□□□ -0.88
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Rpl17Q9CPR4 184 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Nudt8Q9CR24 210 aa9.58□□□□□ -0.88
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Smg9Q9DB90 520 aa9.58□□□□□ -0.88
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Nup188Q6ZQH8 1759 aa9.58□□□□□ -0.88
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Galnt4O08832 578 aa9.58□□□□□ -0.88
Rnf43-201ENSMUST00000040089 StrnO55106 780 aa9.58□□□□□ -0.88
Rnf43-201ENSMUST00000040089 Sdr16c6Q05A13 316 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.2 ms