Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Gm379J3QQ19 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Gm379J3QQ19 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Gm379J3QQ19 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Gm379J3QQ19 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Gm379J3QQ19 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Gm379J3QQ19 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Gm379J3QQ19 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Gm379J3QQ19 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Gm379J3QQ19 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Gm379J3QQ19 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gm379J3QQ19 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Gm379J3QQ19 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gm379J3QQ19 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gm379J3QQ19 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gm379J3QQ19 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gm379J3QQ19 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gm379J3QQ19 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gm379J3QQ19 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Gm379J3QQ19 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gm379J3QQ19 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gm379J3QQ19 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gm379J3QQ19 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Gm379J3QQ19 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gm379J3QQ19 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gm379J3QQ19 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
Gm379J3QQ19 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gm379J3QQ19 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gm379J3QQ19 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gm379J3QQ19 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm379J3QQ19 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gm379J3QQ19 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gm379J3QQ19 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gm379J3QQ19 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gm379J3QQ19 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gm379J3QQ19 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gm379J3QQ19 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gm379J3QQ19 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Gm379J3QQ19 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gm379J3QQ19 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm379J3QQ19 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm379J3QQ19 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gm379J3QQ19 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gm379J3QQ19 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Gm379J3QQ19 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Gm379J3QQ19 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm379J3QQ19 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gm379J3QQ19 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm379J3QQ19 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm379J3QQ19 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gm379J3QQ19 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gm379J3QQ19 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gm379J3QQ19 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gm379J3QQ19 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gm379J3QQ19 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gm379J3QQ19 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gm379J3QQ19 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gm379J3QQ19 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Gm379J3QQ19 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gm379J3QQ19 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gm379J3QQ19 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gm379J3QQ19 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gm379J3QQ19 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gm379J3QQ19 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gm379J3QQ19 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gm379J3QQ19 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm379J3QQ19 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm379J3QQ19 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gm379J3QQ19 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gm379J3QQ19 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm379J3QQ19 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gm379J3QQ19 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gm379J3QQ19 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm379J3QQ19 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm379J3QQ19 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm379J3QQ19 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm379J3QQ19 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm379J3QQ19 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm379J3QQ19 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm379J3QQ19 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gm379J3QQ19 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gm379J3QQ19 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gm379J3QQ19 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gm379J3QQ19 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm379J3QQ19 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm379J3QQ19 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm379J3QQ19 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm379J3QQ19 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm379J3QQ19 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm379J3QQ19 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm379J3QQ19 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm379J3QQ19 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm379J3QQ19 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gm379J3QQ19 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm379J3QQ19 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm379J3QQ19 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm379J3QQ19 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm379J3QQ19 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm379J3QQ19 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm379J3QQ19 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
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