RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579843.5

TRIM16-218, Transcript of tripartite motif containing 16, humanhuman

TSL 4

Gene TRIM16, Length 459 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16-218ENST00000579843 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa7.32□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 RTTNQ86VV8 2226 aa7.32□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 SLC37A4O43826 429 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 CACNG3O60359 315 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 OLFM2O95897 454 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 ABL1P00519 1130 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 EPHX1P07099 455 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 CISD3P0C7P0 127 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 HARSP12081 509 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 TYRP14679 529 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 NR1D1P20393 614 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 UGT1A5P35504 534 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 LIFRP42702 1097 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 DGKGP49619 791 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 CDH8P55286 799 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 SEZ6Q53EL9 994 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 NCAPH2Q6IBW4 605 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 CRTC1Q6UUV9 634 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 METTL23Q86XA0 190 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 TP53INP2Q8IXH6 220 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 ADGRF2Q8IZF7 708 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 FBXO39Q8N4B4 442 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 TTC13Q8NBP0 860 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 OR2T3Q8NH03 318 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 BICD2Q8TD16 824 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 MTA3Q9BTC8 594 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 BBS2Q9BXC9 721 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 RUBCNLQ9H714 662 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 SGK2Q9HBY8 427 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 CYLDQ9NQC7 956 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 PPM1HQ9ULR3 514 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 U3KQA8 63 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 ZNF840PA6NDX5 716 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 EFCAB7A8K855 629 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 CASC3O15234 703 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 NVLO15381 856 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 GIMD1P0DJR0 217 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 HGFP14210 728 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 ACO1P21399 889 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 DGKAP23743 735 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 PRKCHP24723 683 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 NAMPTP43490 491 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 NLRP5P59047 1200 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 RTN1Q16799 776 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 SMTNL2Q2TAL5 461 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 WSCD1Q658N2 575 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 TPGS1Q6ZTW0 290 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 SCN4BQ8IWT1 228 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 ZNF276Q8N554 614 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 SERAC1Q96JX3 654 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 C5orf34Q96MH7 638 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 TCHPQ9BT92 498 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 LRRC2Q9BYS8 371 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 DSEQ9UL01 958 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 DOCK9Q9BZ29 2069 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 TACC2O95359 2948 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 COL6A5A8TX70 2615 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 PTPRJQ12913 1337 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 CPED1A4D0V7 1026 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 TCP11X1B4DZS4 312 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 K7EM74 188 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 K7ERI5 159 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 CYB561D2O14569 222 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 NPC1O15118 1278 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 TCEA3O75764 348 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 LYPLA2O95372 231 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 OAS1P00973 400 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 CXCL8P10145 99 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 MCF2P10911 925 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 CYP3A5P20815 502 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 MCM5P33992 734 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 ADRA1BP35368 520 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 EFNA5P52803 228 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 PDX1P52945 283 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 USP46P62068 366 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 MYL7Q01449 175 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 TSPY1Q01534 308 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 KCNJ12Q14500 433 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 ZNF234Q14588 700 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 ZBTB6Q15916 424 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 CDKN3Q16667 212 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM16-218ENST00000579843 SLC45A4Q5BKX6 768 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms