RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502575.1

PDE4D-209, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 1,040 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-209ENST00000502575 SMARCB1Q12824 385 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 MYO1EQ12965 1108 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 STK4Q13043 487 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 PSMD6Q15008 389 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 SURF1Q15526 300 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 LPAL2Q16609 132 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 CFAP221Q4G0U5 840 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 MDH1BQ5I0G3 518 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 KLHDC7BQ96G42 594 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 PAGE5Q96GU1 130 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 PCED1BQ96HM7 432 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 MYRFLQ96LU7 910 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 CYP2S1Q96SQ9 504 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 MMS19Q96T76 1030 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 FAM83CQ9BQN1 747 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 SEMA4AQ9H3S1 761 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 ABCB6Q9NP58 842 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 GKN1Q9NS71 199 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 ZSCAN32Q9NX65 697 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 OBP2AQ9NY56 170 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 KCNK4Q9NYG8 393 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 USP24Q9UPU5 2620 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 K7ESF4 209 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 SLFN14P0C7P3 912 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 WARSP23381 471 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 PCSK1P29120 753 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 AVPR1AP37288 418 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 MYL6P60660 151 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 DLG4P78352 724 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 ZXDBP98169 803 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 C19orf57Q0VDD7 668 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 ZNF77Q15935 545 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 HS2ST1Q7LGA3 356 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 MON1AQ86VX9 555 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 C12orf56Q8IXR9 622 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 CEP57L1Q8IYX8 460 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 ARMC10Q8N2F6 343 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 SPATA18Q8TC71 538 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 ATRIPQ8WXE1 791 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 RUBCNQ92622 972 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 RMDN1Q96DB5 314 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 FNBP1Q96RU3 617 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 SDCBP2Q9H190 292 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 XYLT2Q9H1B5 865 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 EPC1Q9H2F5 836 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 SMYD3Q9H7B4 428 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 KIAA1586Q9HCI6 787 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 TDP1Q9NUW8 608 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 CDH9Q9ULB4 789 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 HPSEQ9Y251 543 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 WNT6Q9Y6F9 365 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 CKAP5Q14008 2032 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 ZZEF1O43149 2961 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 MEGF11A6BM72 1044 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 ANTXRLA6NF34 631 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 CLDN5O00501 218 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 EXOC3O60645 756 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 ADAM11O75078 769 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 VNN1O95497 513 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 CKMP06732 381 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 CDC25BP30305 580 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 GRIK1P39086 918 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 MAGEA11P43364 429 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 ID4P47928 161 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 FNTBP49356 437 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 CCR3P51677 355 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 NDUFA8P51970 172 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 CDH8P55286 799 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 ORC1Q13415 861 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 RUNX3Q13761 415 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 LRRC32Q14392 662 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 MTF1Q14872 753 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 WDR72Q3MJ13 1102 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-209ENST00000502575 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms