RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-215ENST00000498284 COX11Q9Y6N1 276 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 AOX1Q06278 1338 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 TAF5LO75529 589 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 CSTBP04080 98 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 ITGA5P08648 1049 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 TRAPPC10P48553 1259 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 CFHR3Q02985 330 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 CCDC15Q0P6D6 951 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 SEMA3BQ13214 749 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 BFSP2Q13515 415 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 BLMHQ13867 455 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 CSHL1Q14406 222 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 CCDC38Q502W7 563 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 TMEM63BQ5T3F8 832 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 CCDC174Q6PII3 467 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 ATG16L2Q8NAA4 619 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 OVCA2Q8WZ82 227 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 RMDN3Q96TC7 470 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 PTPRHQ9HD43 1115 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 VPS45Q9NRW7 570 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 RXFP3Q9NSD7 469 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 SYT5O00445 386 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 CTIFO43310 598 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 DNPH1O43598 174 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 PRAMEF2O60811 474 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 GCATO75600 419 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 MMP8P22894 467 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 KLRK1P26718 216 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 GALNSP34059 522 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 SERPINF1P36955 418 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 PROK1P58294 105 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 NHLH1Q02575 133 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 TFF2Q03403 129 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 GRM4Q14833 912 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 PROSER3Q2NL68 480 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 TUBB8Q3ZCM7 444 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 TMEM119Q4V9L6 283 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 MSANTD2Q6P1R3 559 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF788Q6ZQV5 615 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 DNAJC10Q8IXB1 793 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 NRSN1Q8IZ57 195 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 EID2BQ96D98 161 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 CCDC17Q96LX7 622 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 HS6ST2Q96MM7 605 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 LRFN1Q9P244 771 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 FZD4Q9ULV1 537 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 BTBD19C9JJ37 291 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 H3BNC9 293 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 CLIC1O00299 241 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 ACKR2O00590 384 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 C1RP00736 705 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 CHKAP35790 457 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 RAE1P78406 368 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 FAM187BQ17R55 369 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 GRAMD1BQ3KR37 738 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 C4orf46Q504U0 113 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 RINT1Q6NUQ1 792 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 TMEM65Q6PI78 240 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 DCDC5Q6ZRR9 648 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 CHSY1Q86X52 802 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 CERS3Q8IU89 383 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 SMC5Q8IY18 1101 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 GALNT4Q8N4A0 578 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 HASPINQ8TF76 798 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 WDR60Q8WVS4 1066 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 KAZALD1Q96I82 304 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 RITA1Q96K30 269 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 CRAMP1Q96RY5 1269 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 KATNAL1Q9BW62 490 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 DACT1Q9NYF0 836 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 VPS4AQ9UN37 437 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 CCDC187A0A096LP49 1063 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 TISP43B9A030 160 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 PRRT4C9JH25 899 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-215ENST00000498284 UBE2Q2LH0YL09 131 aa5.09□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms