RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	CSF2RA	P15509	400 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	AXL	P30530	894 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBXN1	Q04323	297 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRMP	Q12912	555 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	NOTUM	Q6P988	496 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	CBLL1	Q75N03	491 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q8N3U1	123 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	OXR1	Q8N573	874 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBR7	Q8N806	425 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	TC2N	Q8N9U0	490 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	ABHD8	Q96I13	439 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	APOL6	Q9BWW8	343 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	SDCBP2	Q9H190	292 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHST12	Q9NRB3	414 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	RGS18	Q9NS28	235 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	NME7	Q9Y5B8	376 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	COL4A6	Q14031	1691 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	WNT9A	O14904	365 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	INPPL1	O15357	1258 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	NPHS1	O60500	1241 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	OFD1	O75665	1012 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	TIMP1	P01033	207 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	KCNE1	P15382	129 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	CASP14	P31944	242 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	ABCD1	P33897	745 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	HK2	P52789	917 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	MYL6	P60660	151 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	MYL7	Q01449	175 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	ENPEP	Q07075	957 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	BFSP2	Q13515	415 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	WDR59	Q6PJI9	974 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	ABI1	Q8IZP0	508 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	LILRA2	Q8N149	483 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	RABGGTA	Q92696	567 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC51	Q96ER9	411 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	ACAP3	Q96P50	834 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	GAD1	Q99259	594 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	TET1	Q8NFU7	2136 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A0U1RQJ8	604 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANO9	A1A5B4	782 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARL5C	A6NH57	179 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266		M0QZ92	97 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	DDHD2	O94830	711 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	CRTAM	O95727	393 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC00271	P0C7V0	271 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRT13	P13646	458 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	SYN1	P17600	705 aa		6.58	□□□□□ -1.36

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