RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419504.5

TNS1-205, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 5,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-205ENST00000419504 TMEM121Q9BTD3 319 aa13.47□□□□□ -0.25
TNS1-205ENST00000419504 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa13.47□□□□□ -0.25
TNS1-205ENST00000419504 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa13.46□□□□□ -0.25
TNS1-205ENST00000419504 MGAT4DA6NG13 374 aa13.46□□□□□ -0.25
TNS1-205ENST00000419504 GHRP10912 638 aa13.46□□□□□ -0.25
TNS1-205ENST00000419504 YY1P25490 414 aa13.46□□□□□ -0.25
TNS1-205ENST00000419504 TKTP29401 623 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
TNS1-205ENST00000419504 AQP5P55064 265 aa13.46□□□□□ -0.25
TNS1-205ENST00000419504 MMRN1Q13201 1228 aa13.46□□□□□ -0.25
TNS1-205ENST00000419504 CPNE1Q99829 537 aa13.46□□□□□ -0.25
TNS1-205ENST00000419504 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
TNS1-205ENST00000419504 CAAP1Q9H8G2 361 aa13.46□□□□□ -0.25
TNS1-205ENST00000419504 UBXN8O00124 270 aa13.46□□□□□ -0.25
TNS1-205ENST00000419504 EPB42P16452 691 aa13.46□□□□□ -0.25
TNS1-205ENST00000419504 GPC1P35052 558 aa13.46□□□□□ -0.25
TNS1-205ENST00000419504 PURAQ00577 322 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
TNS1-205ENST00000419504 AMPD2Q01433 879 aa13.46□□□□□ -0.25
TNS1-205ENST00000419504 KLHL4Q9C0H6 718 aa13.46□□□□□ -0.25
TNS1-205ENST00000419504 VTA1Q9NP79 307 aa13.46□□□□□ -0.25
TNS1-205ENST00000419504 KRT84Q9NSB2 600 aa13.46□□□□□ -0.25
TNS1-205ENST00000419504 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa13.46□□□□□ -0.25
TNS1-205ENST00000419504 USE1Q9NZ43 259 aa13.46□□□□□ -0.25
TNS1-205ENST00000419504 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP13.46□□□□□ -0.251e-6■■■■■ 27.7
TNS1-205ENST00000419504 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa13.46□□□□□ -0.25
TNS1-205ENST00000419504 STRNO43815 780 aa13.46□□□□□ -0.25
TNS1-205ENST00000419504 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
TNS1-205ENST00000419504 CYP2A7P20853 494 aa13.46□□□□□ -0.25
TNS1-205ENST00000419504 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
TNS1-205ENST00000419504 UBE3AQ05086 875 aa13.46□□□□□ -0.25
TNS1-205ENST00000419504 CDC16Q13042 620 aa13.46□□□□□ -0.25
TNS1-205ENST00000419504 PGS1Q32NB8 556 aa13.46□□□□□ -0.25
TNS1-205ENST00000419504 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
TNS1-205ENST00000419504 NT5DC1Q5TFE4 455 aa13.46□□□□□ -0.25
TNS1-205ENST00000419504 ZPBP2Q6X784 338 aa13.46□□□□□ -0.25
TNS1-205ENST00000419504 ZNF786Q8N393 782 aa13.46□□□□□ -0.25
TNS1-205ENST00000419504 SMARCD1Q96GM5 515 aa13.46□□□□□ -0.25
TNS1-205ENST00000419504 KCNQ5Q9NR82 932 aa13.46□□□□□ -0.25
TNS1-205ENST00000419504 CENPAP49450 140 aa13.46□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 KCNMA1Q12791 1236 aa13.46□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 PKN1Q16512 942 aa13.46□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 AGXT2Q9BYV1 514 aa13.46□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 RXFP1Q9HBX9 757 aa13.46□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 COMMD8Q9NX08 183 aa13.46□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 SATB2Q9UPW6 733 aa13.46□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 V9GYQ6 96 aa13.46□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa13.46□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 FRMPD4Q14CM0 1322 aa13.46□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa13.46□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 SAC3D1A6NKF1 404 aa13.46□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 PTPN4P29074 926 aa13.46□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 CCNG1P51959 295 aa13.46□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 GRIK4Q16099 956 aa13.46□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 SYT15Q9BQS2 421 aa13.46□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 DCLRE1BQ9H816 532 aa13.46□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 AHSPQ9NZD4 102 aa13.46□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 STK39Q9UEW8 545 aa13.46□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 TMEM114B3SHH9 223 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 SCTRP47872 440 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 RASA2Q15283 850 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 CCDC81Q6ZN84 652 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 ARMC7Q9H6L4 198 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 NT5MQ9NPB1 228 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 HAO1Q9UJM8 370 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 A0A087WZ62 844 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 CKMP06732 381 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 CD151P48509 253 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 ZNF544Q6NX49 715 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 SLC27A1Q6PCB7 646 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 SV2AQ7L0J3 742 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 SPATC1LQ9H0A9 340 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 WDR41Q9HAD4 459 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 ADAM30Q9UKF2 790 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 PRKAA1Q13131 559 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 MTM1Q13496 603 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 NTRK3Q16288 839 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 SERPINB11Q96P15 392 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 ASB2Q96Q27 587 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 UBE2Q2LH0YL09 131 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 TK2O00142 265 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 NR5A2O00482 541 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 CXCL11O14625 94 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 CKBP12277 381 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 SOX11P35716 441 aa13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms