RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 USP12O75317 370 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 RASAL1O95294 804 aa4.72□□□□□ -1.65
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PTPRC-202ENST00000367364 ERVFC1-1P60608 527 aa4.72□□□□□ -1.65
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PTPRC-202ENST00000367364 FAM76BQ5HYJ3 339 aa4.72□□□□□ -1.65
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PTPRC-202ENST00000367364 CACHD1Q5VU97 1274 aa4.72□□□□□ -1.65
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PTPRC-202ENST00000367364 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
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PTPRC-202ENST00000367364 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-202ENST00000367364 RGS10O43665 173 aa4.7□□□□□ -1.66
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PTPRC-202ENST00000367364 TFEBP19484 476 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-202ENST00000367364 WDR5P61964 334 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
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PTPRC-202ENST00000367364 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-202ENST00000367364 USP49Q70CQ1 688 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-202ENST00000367364 ADGRF4Q8IZF3 695 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-202ENST00000367364 C11orf44Q8N8P7 122 aa4.7□□□□□ -1.66
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PTPRC-202ENST00000367364 LPAR1Q92633 364 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-202ENST00000367364 EME1Q96AY2 570 aa4.7□□□□□ -1.66
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PTPRC-202ENST00000367364 PLK2Q9NYY3 685 aa4.7□□□□□ -1.66
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PTPRC-202ENST00000367364 KIR2DS3K7RE56 304 aa4.69□□□□□ -1.66
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PTPRC-202ENST00000367364 INSCQ1MX18 579 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-202ENST00000367364 WASHC2DQ5SRD0 308 aa4.68□□□□□ -1.66
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PTPRC-202ENST00000367364 NT5C1BQ96P26 610 aa4.68□□□□□ -1.66
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PTPRC-202ENST00000367364 RAB32Q13637 225 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-202ENST00000367364 ANO6Q4KMQ2 910 aa4.67□□□□□ -1.66
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PTPRC-202ENST00000367364 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-202ENST00000367364 TM6SF1Q9BZW5 370 aa4.67□□□□□ -1.66
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PTPRC-202ENST00000367364 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
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