RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042312.13

Trafd1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trafd1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ythdf1P59326 559 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dusp16Q6PCP3 660 aa22.82■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mettl21cQ8BLU2 248 aa22.82■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 AA792892Q8C6S1 278 aa22.82■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tubgcp4Q9D4F8 667 aa22.82■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 GmprQ9DCZ1 345 aa22.82■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slc4a11A2AJN7 862 aa22.81■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Celf5D3Z4T1 395 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Morc3F7BJB9 942 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Il1rapl1P59823 695 aa22.81■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sox8Q04886 464 aa22.81■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Faf2Q3TDN2 445 aa22.81■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lrrn4clQ3TYX2 239 aa22.81■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fam189a2Q4FZH1 290 aa22.81■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tab3Q571K4 716 aa22.81■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 B3gnt3Q5JCS9 372 aa22.81■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Luc7l3Q5SUF2 432 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tcaf3Q6QR59 914 aa22.81■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Wscd1Q80XH4 572 aa22.81■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 NaprtQ8CC86 538 aa22.81■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Unc45bQ8CGY6 931 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pglyrp2Q8VCS0 530 aa22.81■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Chst12Q99LL3 419 aa22.81■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mrps9Q9D7N3 390 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Msh5Q9QUM7 833 aa22.81■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 ClcnkbQ9WUB6 687 aa22.81■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cntnap5aQ0V8T9 1304 aa22.81■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm6205E9PZS2 359 aa22.81■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Vmn2r87E9PZX4 848 aa22.81■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Abhd12bG3UZN6 359 aa22.81■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 SprtnG3X912 497 aa22.81■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 FaahO08914 579 aa22.81■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CidebO70303 219 aa22.81■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Thumpd3P97770 505 aa22.81■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zbtb48Q1H9T6 681 aa22.81■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trcg1Q58Y74 825 aa22.81■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atp4aQ64436 1033 aa22.81■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ino80dQ66JY2 873 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm6367Q8C6L9 287 aa22.81■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Agbl2Q8CDK2 862 aa22.81■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mkl1Q8K4J6 964 aa22.81■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tekt1Q9DAJ2 418 aa22.81■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Top3bQ9Z321 862 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Speer3W4VSP1 261 aa22.81■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 StrnO55106 780 aa22.8■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 ShdO88834 343 aa22.8■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lpar1P61793 364 aa22.8■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Oas1fQ14AZ4 364 aa22.8■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Arid5aQ3U108 590 aa22.8■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 McuQ3UMR5 350 aa22.8■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Scaf4Q6PFF0 1209 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atg16l1Q8C0J2 607 aa22.8■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dis3lQ8C0S1 1053 aa22.8■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Vopp1Q8R1C3 172 aa22.8■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tomm20lQ9D4V6 152 aa22.8■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cep83Q9D5R3 692 aa22.8■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ptpn4Q9WU22 926 aa22.8■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zfc3h1B2RT41 1992 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gjd2O54851 321 aa22.8■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PrkcdP28867 674 aa22.8■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cln3Q61124 438 aa22.8■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sh3gl3Q62421 347 aa22.8■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Arhgap18Q8K0Q5 663 aa22.8■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Grk2Q99MK8 689 aa22.8■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 SarnpQ9D1J3 210 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atg7Q9D906 698 aa22.8■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PllpQ9DCU2 182 aa22.8■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Serpinb3cA2RSF9 386 aa22.79■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cyp2c69E9PXC3 491 aa22.79■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tnk2O54967 1055 aa22.79■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cyp2c40P56657 491 aa22.79■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmem82Q8R115 356 aa22.79■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rabep2Q91WG2 554 aa22.79■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kat2aQ9JHD2 830 aa22.79■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Usp21Q9QZL6 566 aa22.79■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 MipP51180 263 aa22.79■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Serpina6Q06770 397 aa22.79■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Prmt6Q6NZB1 378 aa22.79■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Twf2Q9Z0P5 349 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mtm1Q9Z2C5 603 aa22.79■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm7694J3QNH8 270 aa22.78■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rpl10aP53026 217 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fermt1P59113 677 aa22.78■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Il6stQ00560 917 aa22.78■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Xlr3cQ61806 226 aa22.78■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mea1Q64327 174 aa22.78■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cyp2c29Q64458 490 aa22.78■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Capn11Q6J756 714 aa22.78■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rimbp2Q80U40 1072 aa22.78■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dlk2Q8K1E3 382 aa22.78■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 FdpsQ920E5 353 aa22.78■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pex6Q99LC9 981 aa22.78■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cdr1E9Q0B4 517 aa22.78■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mroh4G3X8W1 983 aa22.78■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sept7O55131 436 aa22.78■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hcn2O88703 863 aa22.78■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pim1P06803 397 aa22.78■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 SnnP61807 88 aa22.78■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Esyt3Q5DTI8 891 aa22.78■■□□□ 1.24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Stx3Q64704 289 aa22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.7 ms