Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Atg16l1Q8C0J2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Atg16l1Q8C0J2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Atg16l1Q8C0J2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Atg16l1Q8C0J2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Atg16l1Q8C0J2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Atg16l1Q8C0J2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Atg16l1Q8C0J2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Atg16l1Q8C0J2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Atg16l1Q8C0J2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Atg16l1Q8C0J2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Atg16l1Q8C0J2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Atg16l1Q8C0J2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Atg16l1Q8C0J2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Atg16l1Q8C0J2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Atg16l1Q8C0J2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Atg16l1Q8C0J2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Atg16l1Q8C0J2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Atg16l1Q8C0J2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Atg16l1Q8C0J2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Atg16l1Q8C0J2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Atg16l1Q8C0J2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Atg16l1Q8C0J2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Atg16l1Q8C0J2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Atg16l1Q8C0J2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Atg16l1Q8C0J2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Atg16l1Q8C0J2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Atg16l1Q8C0J2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Atg16l1Q8C0J2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Atg16l1Q8C0J2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Atg16l1Q8C0J2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Atg16l1Q8C0J2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Atg16l1Q8C0J2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atg16l1Q8C0J2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atg16l1Q8C0J2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Atg16l1Q8C0J2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atg16l1Q8C0J2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atg16l1Q8C0J2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atg16l1Q8C0J2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atg16l1Q8C0J2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Atg16l1Q8C0J2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atg16l1Q8C0J2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Atg16l1Q8C0J2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atg16l1Q8C0J2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Atg16l1Q8C0J2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atg16l1Q8C0J2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Atg16l1Q8C0J2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atg16l1Q8C0J2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atg16l1Q8C0J2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atg16l1Q8C0J2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atg16l1Q8C0J2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atg16l1Q8C0J2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atg16l1Q8C0J2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Atg16l1Q8C0J2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atg16l1Q8C0J2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Atg16l1Q8C0J2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atg16l1Q8C0J2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atg16l1Q8C0J2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Atg16l1Q8C0J2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atg16l1Q8C0J2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atg16l1Q8C0J2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atg16l1Q8C0J2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atg16l1Q8C0J2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atg16l1Q8C0J2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atg16l1Q8C0J2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atg16l1Q8C0J2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atg16l1Q8C0J2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atg16l1Q8C0J2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Atg16l1Q8C0J2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atg16l1Q8C0J2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atg16l1Q8C0J2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atg16l1Q8C0J2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atg16l1Q8C0J2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atg16l1Q8C0J2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atg16l1Q8C0J2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atg16l1Q8C0J2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atg16l1Q8C0J2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atg16l1Q8C0J2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atg16l1Q8C0J2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atg16l1Q8C0J2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atg16l1Q8C0J2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atg16l1Q8C0J2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atg16l1Q8C0J2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atg16l1Q8C0J2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atg16l1Q8C0J2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atg16l1Q8C0J2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atg16l1Q8C0J2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atg16l1Q8C0J2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atg16l1Q8C0J2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Atg16l1Q8C0J2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atg16l1Q8C0J2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atg16l1Q8C0J2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atg16l1Q8C0J2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atg16l1Q8C0J2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atg16l1Q8C0J2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atg16l1Q8C0J2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atg16l1Q8C0J2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms