RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554184.5

CCNB1IP1-210, Transcript of cyclin B1 interacting protein 1, human

TSL 3

Gene CCNB1IP1, Length 513 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MAF1	Q9H063	256 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	KLC4	Q9NSK0	619 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	KCND3	Q9UK17	655 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	WDR27	A2RRH5	827 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184		E7EVH7	732 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PSMD9	O00233	223 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PROM1	O43490	865 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SPRY2	O43597	315 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PEX1	O43933	1283 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PMPCB	O75439	489 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PRKCB	P05771	671 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CYP21A2	P08686	494 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TMEM225B	P0DP42	221 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ALAD	P13716	330 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SEC24C	P53992	1094 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CSHL1	Q14406	222 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CYP1B1	Q16678	543 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SYT13	Q7L8C5	426 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TTC30A	Q86WT1	665 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	VRK3	Q8IV63	474 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CPO	Q8IVL8	374 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	HMGB4	Q8WW32	186 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	COG8	Q96MW5	612 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PRR25	Q96S07	402 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CHODL	Q9H9P2	273 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	EHD3	Q9NZN3	535 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CES2	O00748	559 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZNF202	O95125	648 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ELFN1	P0C7U0	828 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CREB1	P16220	341 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CD53	P19397	219 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MAK	P20794	623 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TACR2	P21452	398 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ITPKB	P27987	946 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GK	P32189	559 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FOLR3	P41439	243 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GSTM5	P46439	218 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TUB	P50607	506 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	E2F1	Q01094	437 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PTPRR	Q15256	657 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TXNRD1	Q16881	649 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TRIM60	Q495X7	471 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GALNTL6	Q49A17	601 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	LRRC24	Q50LG9	513 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	KAZN	Q674X7	775 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184		Q8N1X5	172 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	RSC1A1	Q92681	617 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GOLGA1	Q92805	767 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PDE8B	O95263	885 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	C6	P13671	934 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CD19	P15391	556 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ENG	P17813	658 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CTGF	P29279	349 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CYP2C18	P33260	490 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MCM7	P33993	719 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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