RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 CYP3A7P24462 503 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 PRCPP42785 496 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 ADCY2Q08462 1091 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 CNTN1Q12860 1018 aa8.33□□□□□ -1.08
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PTPRB-209ENST00000550857 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 XKR4Q5GH76 650 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.33□□□□□ -1.08
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PTPRB-209ENST00000550857 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa8.33□□□□□ -1.08
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PTPRB-209ENST00000550857 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
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PTPRB-209ENST00000550857 VSTM4Q8IW00 320 aa8.32□□□□□ -1.08
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PTPRB-209ENST00000550857 CNGB3Q9NQW8 809 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 HACD1B0YJ81 288 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 MPOP05164 745 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 WEE2P0C1S8 567 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 KCNA2P16389 499 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
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