RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGEF19Q8IW93 802 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC4BQ9NT99 713 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 RAD54BQ9Y620 910 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 EML1O00423 815 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 CYB5D1Q6P9G0 228 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 CARNMT1Q8N4J0 409 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 HAO1Q9UJM8 370 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 V9GYQ6 96 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC10BA6NIK2 292 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 PDHXO00330 501 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 SERPINF2P08697 491 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 MAPK1P28482 360 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 CYP4F12Q9HCS2 524 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 HOXC6P09630 235 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 AXLP30530 894 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 BTKQ06187 659 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF410Q86VK4 478 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 DNAAF5Q86Y56 855 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 AKT1S1Q96B36 256 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 SLC25A13Q9UJS0 675 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 A0A087X0B3 334 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 KRT87PA6NCN2 255 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 M0R3G1 203 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 DAB1O75553 588 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 CLK1P49759 484 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 EPHB3P54753 998 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 CDH17Q12864 832 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 MTA1Q13330 715 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 DNAJB3Q8WWF6 145 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 NQO1P15559 274 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 SERPINB5P36952 375 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 RETSATQ6NUM9 610 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 GANQ9H2C0 597 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 AK9Q5TCS8 1911 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 PXDNQ92626 1479 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 EPB42P16452 691 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 CALB2P22676 271 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 RENBPP51606 427 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 TADA1Q96BN2 335 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 ACAP1Q15027 740 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 MICU2Q8IYU8 434 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 KAT2BQ92831 832 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 DDNO94850 711 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 PYGMP11217 842 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 RCN1Q15293 331 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 LZTR1Q8N653 840 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 MTMR9Q96QG7 549 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 RMND5AQ9H871 391 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 CBX4O00257 560 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 PLA2G6O60733 806 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 CHRNB3Q05901 458 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 MEA1Q16626 185 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 VGLL2Q8N8G2 317 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 VPS50Q96JG6 964 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 YME1L1Q96TA2 773 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 ENDOD1O94919 500 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 WDR47O94967 919 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 TPBGLP0DKB5 382 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 GP5P40197 560 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 SLC12A3P55017 1021 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 ADIGQ0VDE8 80 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 ELK3P41970 407 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 NR2C2P49116 596 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 NCKAP1LP55160 1127 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 CSHL1Q14406 222 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 DEPDC1Q5TB30 811 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 MKL1Q969V6 931 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 PRKD2Q9BZL6 878 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms