RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000218686.1

Trappc6b-207, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc6b, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Q9D9D9 101 aa22.67■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 FignQ9ERZ6 759 aa22.67■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gjb3P28231 270 aa22.66■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Arhgap39P59281 1107 aa22.66■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ugt1a2P70691 533 aa22.66■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Specc1lQ2KN98 1118 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Aarsd1Q3THG9 412 aa22.66■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ccdc61Q3UJV1 511 aa22.66■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Lrch2Q3UMG5 773 aa22.66■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 MlipQ5FW52 269 aa22.66■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Shc3Q61120 474 aa22.66■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ugt1a9Q62452 528 aa22.66■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ugt1a1Q63886 535 aa22.66■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 DstykQ6XUX1 927 aa22.66■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Taf15Q8BQ46 557 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Defb22Q8BVC1 179 aa22.66■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ccdc14Q8K2J4 934 aa22.66■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tpgs1Q99MS8 303 aa22.66■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ndufv2Q9D6J6 248 aa22.66■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Hyou1Q9JKR6 999 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Atg2bQ80XK6 2075 aa22.66■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 AtrxQ61687 2476 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Hmga1P17095 107 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Anxa5P48036 319 aa22.65■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 MylpfP97457 169 aa22.65■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Togaram2Q3TYG6 1002 aa22.65■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pak6Q3ULB5 682 aa22.65■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Krt15Q61414 452 aa22.65■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Oca2Q62052 833 aa22.65■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Lrig3Q6P1C6 1117 aa22.65■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fmnl3Q6ZPF4 1028 aa22.65■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Olfr26Q7TRB7 308 aa22.65■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slu7Q8BHJ9 585 aa22.65■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Acad9Q8JZN5 625 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tbc1d19Q8VDV7 526 aa22.65■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 DeraQ91YP3 318 aa22.65■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pdxdc1Q99K01 787 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mzb1Q9D8I1 188 aa22.65■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Olfr933Q9EQA0 308 aa22.65■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rnf14Q9JI90 485 aa22.65■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Znf354bQ9QXT9 601 aa22.65■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Eif2ak3Q9Z2B5 1114 aa22.65■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Myo15aQ9QZZ4 3511 aa22.65■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rai1Q61818 1889 aa22.64■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 NbeaQ9EPN1 2936 aa22.64■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Myh10Q61879 1976 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zfand4D3Z3C6 739 aa22.64■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ctnnd1P30999 938 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rfx2P48379 717 aa22.64■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Uchl4P58321 233 aa22.64■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Klra9Q2TJJ8 266 aa22.64■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Q3UZV7 1028 aa22.64■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 HecaQ3V1N5 544 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zfp36l3Q5ISE2 725 aa22.64■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Abcf1Q6P542 837 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dnph1Q80VJ3 173 aa22.64■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ints4Q8CIM8 964 aa22.64■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slc26a6Q8CIW6 758 aa22.64■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ace2Q8R0I0 805 aa22.64■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ppp1r16aQ923M0 524 aa22.64■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 TrabdQ99JY4 376 aa22.64■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Myo10F8VQB6 2062 aa22.64■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Znf106O88466 1888 aa22.63■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tmem235B1AQL3 211 aa22.63■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cntn5P68500 1098 aa22.63■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ppp4r3cQ3V0Y1 813 aa22.63■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cyfip2Q5SQX6 1253 aa22.63■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pced1aQ6P1Z5 449 aa22.63■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tmeff1Q6PFE7 372 aa22.63■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Olfr212Q7TS33 327 aa22.63■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Q8CDN1 933 aa22.63■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Q91Z58 1206 aa22.63■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 AdarQ99MU3 1178 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tex46Q9CPU3 165 aa22.63■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Iigp1Q9QZ85 413 aa22.63■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sec14l1A8Y5H7 715 aa22.62■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 9230113P08RikD3YWX3 137 aa22.62■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Per3O70361 1113 aa22.62■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Myl1P05977 188 aa22.62■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PrphP15331 475 aa22.62■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fermt1P59113 677 aa22.62■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Serpina5P70458 405 aa22.62■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 IhhP97812 411 aa22.62■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zkscan4Q5SZT6 480 aa22.62■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Noc4lQ8BHY2 516 aa22.62■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ccdc187Q8C5V8 958 aa22.62■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zc2hc1cQ8CCG1 527 aa22.62■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Znf131Q8K3J5 619 aa22.62■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Synpo2Q91YE8 1087 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 1700020D05RikQ99PB1 294 aa22.62■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Bnc1O35914 961 aa22.61■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PkmP52480 531 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Usp46P62069 366 aa22.61■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ect2Q07139 913 aa22.61■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pik3r6Q3U6Q4 756 aa22.61■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rnf224Q3UIW8 156 aa22.61■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tra2aQ6PFR5 281 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fbxw21Q8BI38 468 aa22.61■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tp53inp2Q8CFU8 221 aa22.61■■□□□ 1.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cwf19l1Q8CI33 537 aa22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.9 ms