Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38,86■■■■□ 3,81
Tmeff1Q6PFE7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36,08■■■■□ 3,37
Tmeff1Q6PFE7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,54■■■■□ 3,28
Tmeff1Q6PFE7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33,82■■■■□ 3
Tmeff1Q6PFE7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33,67■■■□□ 2,98
Tmeff1Q6PFE7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,85■■■□□ 2,85
Tmeff1Q6PFE7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
Tmeff1Q6PFE7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Tmeff1Q6PFE7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,83
Tmeff1Q6PFE7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32,41■■■□□ 2,78
Tmeff1Q6PFE7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
Tmeff1Q6PFE7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Tmeff1Q6PFE7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31,67■■■□□ 2,66
Tmeff1Q6PFE7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
Tmeff1Q6PFE7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Tmeff1Q6PFE7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31,37■■■□□ 2,61
Tmeff1Q6PFE7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,35■■■□□ 2,61
Tmeff1Q6PFE7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Tmeff1Q6PFE7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31,15■■■□□ 2,58
Tmeff1Q6PFE7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Tmeff1Q6PFE7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Tmeff1Q6PFE7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,8■■■□□ 2,52
Tmeff1Q6PFE7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30,79■■■□□ 2,52
Tmeff1Q6PFE7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Tmeff1Q6PFE7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30,76■■■□□ 2,51
Tmeff1Q6PFE7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Tmeff1Q6PFE7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Tmeff1Q6PFE7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,48■■■□□ 2,47
Tmeff1Q6PFE7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Tmeff1Q6PFE7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Tmeff1Q6PFE7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Tmeff1Q6PFE7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Tmeff1Q6PFE7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30,11■■■□□ 2,41
Tmeff1Q6PFE7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Tmeff1Q6PFE7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,9■■■□□ 2,38
Tmeff1Q6PFE7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29,82■■■□□ 2,36
Tmeff1Q6PFE7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,8■■■□□ 2,36
Tmeff1Q6PFE7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Tmeff1Q6PFE7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Tmeff1Q6PFE7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Tmeff1Q6PFE7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29,63■■■□□ 2,33
Tmeff1Q6PFE7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Tmeff1Q6PFE7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Tmeff1Q6PFE7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Tmeff1Q6PFE7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29,44■■■□□ 2,3
Tmeff1Q6PFE7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Tmeff1Q6PFE7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Tmeff1Q6PFE7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Tmeff1Q6PFE7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29,13■■■□□ 2,25
Tmeff1Q6PFE7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29,11■■■□□ 2,25
Tmeff1Q6PFE7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29,1■■■□□ 2,25
Tmeff1Q6PFE7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Tmeff1Q6PFE7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,05■■■□□ 2,24
Tmeff1Q6PFE7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Tmeff1Q6PFE7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29,01■■■□□ 2,23
Tmeff1Q6PFE7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Tmeff1Q6PFE7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Tmeff1Q6PFE7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Tmeff1Q6PFE7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,88■■■□□ 2,21
Tmeff1Q6PFE7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Tmeff1Q6PFE7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28,82■■■□□ 2,2
Tmeff1Q6PFE7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Tmeff1Q6PFE7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Tmeff1Q6PFE7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Tmeff1Q6PFE7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28,72■■■□□ 2,19
Tmeff1Q6PFE7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28,71■■■□□ 2,19
Tmeff1Q6PFE7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,68■■■□□ 2,18
Tmeff1Q6PFE7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Tmeff1Q6PFE7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Tmeff1Q6PFE7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Tmeff1Q6PFE7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Tmeff1Q6PFE7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Tmeff1Q6PFE7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Tmeff1Q6PFE7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Tmeff1Q6PFE7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Tmeff1Q6PFE7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Tmeff1Q6PFE7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Tmeff1Q6PFE7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Tmeff1Q6PFE7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Tmeff1Q6PFE7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Tmeff1Q6PFE7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Tmeff1Q6PFE7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Tmeff1Q6PFE7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Tmeff1Q6PFE7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Tmeff1Q6PFE7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28,1■■■□□ 2,09
Tmeff1Q6PFE7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,1■■■□□ 2,09
Tmeff1Q6PFE7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Tmeff1Q6PFE7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28,07■■■□□ 2,08
Tmeff1Q6PFE7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Tmeff1Q6PFE7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Tmeff1Q6PFE7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Tmeff1Q6PFE7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Tmeff1Q6PFE7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,99■■■□□ 2,07
Tmeff1Q6PFE7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Tmeff1Q6PFE7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Tmeff1Q6PFE7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Tmeff1Q6PFE7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27,89■■■□□ 2,06
Tmeff1Q6PFE7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Tmeff1Q6PFE7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27,84■■■□□ 2,05
Tmeff1Q6PFE7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
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