Protein–RNA interactions for Protein: Q61818

Rai1, Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai1Q61818 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38,81■■■■□ 3,8
Rai1Q61818 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36,1■■■■□ 3,37
Rai1Q61818 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,31■■■■□ 3,24
Rai1Q61818 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33,86■■■■□ 3,01
Rai1Q61818 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33,74■■■□□ 2,99
Rai1Q61818 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33,1■■■□□ 2,89
Rai1Q61818 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,85
Rai1Q61818 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Rai1Q61818 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Rai1Q61818 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,79
Rai1Q61818 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Rai1Q61818 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32,34■■■□□ 2,77
Rai1Q61818 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Rai1Q61818 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31,56■■■□□ 2,64
Rai1Q61818 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Rai1Q61818 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,29■■■□□ 2,6
Rai1Q61818 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31,27■■■□□ 2,6
Rai1Q61818 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,19■■■□□ 2,58
Rai1Q61818 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Rai1Q61818 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,98■■■□□ 2,55
Rai1Q61818 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Rai1Q61818 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Rai1Q61818 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Rai1Q61818 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,81■■■□□ 2,52
Rai1Q61818 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Rai1Q61818 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Rai1Q61818 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30,7■■■□□ 2,5
Rai1Q61818 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30,67■■■□□ 2,5
Rai1Q61818 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Rai1Q61818 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Rai1Q61818 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Rai1Q61818 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Rai1Q61818 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,24■■■□□ 2,43
Rai1Q61818 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30,16■■■□□ 2,42
Rai1Q61818 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Rai1Q61818 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Rai1Q61818 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Rai1Q61818 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Rai1Q61818 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29,8■■■□□ 2,36
Rai1Q61818 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Rai1Q61818 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,72■■■□□ 2,35
Rai1Q61818 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29,7■■■□□ 2,34
Rai1Q61818 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,59■■■□□ 2,33
Rai1Q61818 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Rai1Q61818 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29,48■■■□□ 2,31
Rai1Q61818 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29,4■■■□□ 2,3
Rai1Q61818 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29,39■■■□□ 2,3
Rai1Q61818 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Rai1Q61818 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Rai1Q61818 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Rai1Q61818 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29,1■■■□□ 2,25
Rai1Q61818 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29,1■■■□□ 2,25
Rai1Q61818 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Rai1Q61818 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Rai1Q61818 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Rai1Q61818 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Rai1Q61818 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Rai1Q61818 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Rai1Q61818 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Rai1Q61818 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Rai1Q61818 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Rai1Q61818 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Rai1Q61818 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Rai1Q61818 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,83■■■□□ 2,21
Rai1Q61818 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28,81■■■□□ 2,2
Rai1Q61818 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28,79■■■□□ 2,2
Rai1Q61818 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28,74■■■□□ 2,19
Rai1Q61818 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Rai1Q61818 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,67■■■□□ 2,18
Rai1Q61818 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Rai1Q61818 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,63■■■□□ 2,17
Rai1Q61818 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Rai1Q61818 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Rai1Q61818 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Rai1Q61818 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Rai1Q61818 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Rai1Q61818 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Rai1Q61818 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Rai1Q61818 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Rai1Q61818 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Rai1Q61818 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Rai1Q61818 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Rai1Q61818 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Rai1Q61818 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Rai1Q61818 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Rai1Q61818 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Rai1Q61818 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28,2■■■□□ 2,1
Rai1Q61818 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,17■■■□□ 2,1
Rai1Q61818 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Rai1Q61818 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Rai1Q61818 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,14■■■□□ 2,1
Rai1Q61818 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Rai1Q61818 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Rai1Q61818 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28,05■■■□□ 2,08
Rai1Q61818 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Rai1Q61818 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Rai1Q61818 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Rai1Q61818 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Rai1Q61818 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,96■■■□□ 2,07
Rai1Q61818 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
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