RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Apba1B2RUJ5 842 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Abhd12bG3UZN6 359 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fgfr2P21803 821 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pi4k2aQ2TBE6 479 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rbbp7Q60973 425 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fndc3bQ6NWW9 1207 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rtl3Q6P1Y1 553 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dennd2cQ6P9P8 914 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 IntS13Q8QZV7 732 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CatsperzQ9CQP8 194 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RhoaQ9QUI0 193 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wnt8bQ9WUD6 350 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cylc2B1AWN8 422 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SprtnG3X912 497 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyp2j6O54750 501 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AurkaP97477 395 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam91a1Q3UVG3 837 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ttc39bQ8BYY4 617 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Efl1Q8C0D5 1127 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prl7b1Q8CGZ9 251 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nox1Q8CIZ9 591 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adi1Q99JT9 179 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PignQ9R1S3 931 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arid3bQ9Z1N7 568 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gli3Q61602 1583 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rsrc2A2RTL5 376 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tnfrsf11bO08712 401 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Marcksl1P28667 200 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppp3ccP48455 513 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Irf5P56477 497 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyth2P63034 400 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Samd11Q1RNF8 542 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kcna5Q61762 602 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Aldh5a1Q8BWF0 523 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 H2-Q4Q8HWB2 354 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PigxQ99LV7 254 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pgm1Q9D0F9 562 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sertad2Q9JJG5 309 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ThegQ9JMB1 375 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Smok2bQ9QYZ3 484 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Smok2aQ9QYZ6 504 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sf3b1Q99NB9 1304 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rpl7aP12970 266 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 H2afxP27661 143 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Guca1aP43081 202 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Myl2P51667 166 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyp2c37P56654 490 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sparcl1P70663 650 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klra3Q64329 266 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 IgflQ6B9Z0 140 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyp2c54Q6XVG2 490 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CgasQ8C6L5 507 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Agr3Q8R3W7 165 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zkscan3Q91VW9 553 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ears2Q9CXJ1 523 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TfgQ9Z1A1 397 aa13.22□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr271-ps1A0A1L1SQH2 283 aa13.21□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Scgb2b7D3YYY1 112 aa13.21□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm43302L7N1X8 611 aa13.21□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Brcc3P46737 291 aa13.21□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gbp10Q000W5 611 aa13.21□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zmym5Q3U2E2 627 aa13.21□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ptk6Q64434 451 aa13.21□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Xpnpep1Q6P1B1 623 aa13.21□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trmt13Q8BYH3 481 aa13.21□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tas1r3Q925D8 858 aa13.21□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 LrgukQ9D5S7 820 aa13.21□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prl2b1Q9DAZ2 228 aa13.21□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PigoQ9JJI6 1093 aa13.21□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PodxlQ9R0M4 503 aa13.21□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Col5a2Q3U962 1497 aa13.21□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Oas1eA0A0J9YV76 386 aa13.21□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tatdn2B7ZNL9 783 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp839E9PUU5 921 aa13.21□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pold2O35654 469 aa13.21□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sept4P28661 478 aa13.21□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PtpaP58389 323 aa13.21□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TankP70347 448 aa13.21□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fads2p1Q0VAX3 487 aa13.21□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ssxb5Q6XAS2 159 aa13.21□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cand2Q6ZQ73 1235 aa13.21□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Epn3Q91W69 636 aa13.21□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vangl2Q91ZD4 521 aa13.21□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Frmd4bQ920B0 1035 aa13.21□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prmt2Q9R144 448 aa13.21□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prpmp5E9PXN1 296 aa13.21□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Clk2O35491 499 aa13.21□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PolP11369 1281 aa13.21□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Acsl1P41216 699 aa13.21□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gp1bbP56400 206 aa13.21□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mc4rP56450 332 aa13.21□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Emilin3P59900 758 aa13.21□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pik3r6Q3U6Q4 756 aa13.21□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tbc1d12Q6A039 696 aa13.21□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Exoc3l4Q6DIA2 721 aa13.21□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc9b1Q8C0X2 565 aa13.21□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dedd2Q8QZV0 330 aa13.21□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kdelr1Q99JH8 212 aa13.21□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TheglQ9DA15 459 aa13.21□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Capn7Q9R1S8 813 aa13.21□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 40.2 ms