Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ73

Cand2, Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cand2Q6ZQ73 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
Cand2Q6ZQ73 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cand2Q6ZQ73 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Cand2Q6ZQ73 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cand2Q6ZQ73 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Cand2Q6ZQ73 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Cand2Q6ZQ73 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cand2Q6ZQ73 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cand2Q6ZQ73 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Cand2Q6ZQ73 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cand2Q6ZQ73 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cand2Q6ZQ73 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cand2Q6ZQ73 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Cand2Q6ZQ73 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Cand2Q6ZQ73 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Cand2Q6ZQ73 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Cand2Q6ZQ73 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Cand2Q6ZQ73 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Cand2Q6ZQ73 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Cand2Q6ZQ73 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Cand2Q6ZQ73 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Cand2Q6ZQ73 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Cand2Q6ZQ73 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Cand2Q6ZQ73 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Cand2Q6ZQ73 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cand2Q6ZQ73 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Cand2Q6ZQ73 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Cand2Q6ZQ73 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Cand2Q6ZQ73 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Cand2Q6ZQ73 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Cand2Q6ZQ73 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Cand2Q6ZQ73 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Cand2Q6ZQ73 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Cand2Q6ZQ73 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Cand2Q6ZQ73 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Cand2Q6ZQ73 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Cand2Q6ZQ73 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cand2Q6ZQ73 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cand2Q6ZQ73 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cand2Q6ZQ73 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cand2Q6ZQ73 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cand2Q6ZQ73 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cand2Q6ZQ73 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Cand2Q6ZQ73 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cand2Q6ZQ73 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cand2Q6ZQ73 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cand2Q6ZQ73 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cand2Q6ZQ73 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cand2Q6ZQ73 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cand2Q6ZQ73 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cand2Q6ZQ73 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cand2Q6ZQ73 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cand2Q6ZQ73 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cand2Q6ZQ73 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cand2Q6ZQ73 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cand2Q6ZQ73 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Cand2Q6ZQ73 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cand2Q6ZQ73 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cand2Q6ZQ73 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cand2Q6ZQ73 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cand2Q6ZQ73 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cand2Q6ZQ73 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cand2Q6ZQ73 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cand2Q6ZQ73 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cand2Q6ZQ73 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cand2Q6ZQ73 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cand2Q6ZQ73 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Cand2Q6ZQ73 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Cand2Q6ZQ73 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cand2Q6ZQ73 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cand2Q6ZQ73 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cand2Q6ZQ73 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Cand2Q6ZQ73 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cand2Q6ZQ73 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cand2Q6ZQ73 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cand2Q6ZQ73 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cand2Q6ZQ73 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cand2Q6ZQ73 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Cand2Q6ZQ73 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cand2Q6ZQ73 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cand2Q6ZQ73 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cand2Q6ZQ73 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cand2Q6ZQ73 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cand2Q6ZQ73 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cand2Q6ZQ73 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cand2Q6ZQ73 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cand2Q6ZQ73 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cand2Q6ZQ73 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Cand2Q6ZQ73 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cand2Q6ZQ73 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cand2Q6ZQ73 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cand2Q6ZQ73 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cand2Q6ZQ73 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cand2Q6ZQ73 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cand2Q6ZQ73 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cand2Q6ZQ73 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cand2Q6ZQ73 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cand2Q6ZQ73 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cand2Q6ZQ73 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cand2Q6ZQ73 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms