RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kcnq1P97414 668 aa16.6■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prdx5P99029 210 aa16.6■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Serpina1eQ00898 413 aa16.6■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q3TQQ9 903 aa16.6■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Itih3Q61704 889 aa16.6■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 FAM120AQ6A0A9 1112 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tfb1mQ8JZM0 345 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nudt13Q8JZU0 352 aa16.6■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dlk2Q8K1E3 382 aa16.6■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fcho1Q8K285 873 aa16.6■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Catsper1Q91ZR5 686 aa16.6■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CmasQ99KK2 432 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam227aQ9D3V8 625 aa16.6■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ubxn11Q9D572 484 aa16.6■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vwa7Q9JHA8 891 aa16.6■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Krt16Q9Z2K1 469 aa16.6■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SpibO35906 267 aa16.6■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Psma2P49722 234 aa16.6■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp943Q6NZP4 507 aa16.6■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nemp1Q6ZQE4 437 aa16.6■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SowahcQ8C0J6 512 aa16.6■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rmnd1Q8CI78 450 aa16.6■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdc26Q99JP4 85 aa16.6■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rmi1Q9D4G9 616 aa16.6■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ing2Q9ESK4 281 aa16.6■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hey2Q9QUS4 339 aa16.6■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tk2Q9R088 270 aa16.6■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Krt27Q9Z320 448 aa16.6■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Col2a1P28481 1487 aa16.6■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dnase1l3O55070 310 aa16.59■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Phka1P18826 1241 aa16.59■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam172aQ3TNH5 417 aa16.59■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Heatr9Q5QNV8 569 aa16.59■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tpp2Q64514 1262 aa16.59■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sp140Q6NSQ5 534 aa16.59■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mpp5Q9JLB2 675 aa16.59■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atp11cQ9QZW0 1129 aa16.59■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Efcab12V9GXH0 673 aa16.59■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atf6F6VAN0 656 aa16.59■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ChkaO54804 453 aa16.59■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 LgmnO89017 435 aa16.59■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ZfxP17012 799 aa16.59■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rpl5P47962 297 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Spata20Q80YT5 790 aa16.59■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hdhd5Q91WM2 419 aa16.59■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Chst12Q99LL3 419 aa16.59■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 GsdmcQ99NB5 468 aa16.59■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Scyl3Q9DBQ7 735 aa16.59■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cpsf3Q9QXK7 684 aa16.59■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 DcxO88809 366 aa16.59■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sh3bp2Q06649 559 aa16.59■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc26a2Q62273 739 aa16.59■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ino80dQ66JY2 873 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 March4Q80TE3 409 aa16.59■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TgdsQ8VDR7 355 aa16.59■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trip11E9Q512 1976 aa16.58■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 2010300C02RikE9Q3M9 1175 aa16.58■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 En1P09065 401 aa16.58■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cbx2P30658 519 aa16.58■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ythdf1P59326 559 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tas2r102Q7M717 329 aa16.58■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Robo4Q8C310 1012 aa16.58■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lin52Q8CD94 116 aa16.58■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Wdr98Q8VC42 657 aa16.58■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Snrnp25Q8VIK1 123 aa16.58■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pcdhb1Q91Y08 818 aa16.58■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NonoQ99K48 473 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ropn1Q9ESG2 212 aa16.58■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Angptl2Q9R045 493 aa16.58■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TfgQ9Z1A1 397 aa16.58■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp715G3X9T1 886 aa16.58■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp2a4P15392 494 aa16.58■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp2a5P20852 494 aa16.58■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MafP54843 370 aa16.58■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mfhas1Q3V1N1 1048 aa16.58■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam49aQ8BHZ0 323 aa16.58■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PdgfcQ8CI19 345 aa16.58■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 UvragQ8K245 698 aa16.58■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rell1Q8K2J7 272 aa16.58■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PlvapQ91VC4 438 aa16.58■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Med7Q9CZB6 233 aa16.58■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q9D1Z2 194 aa16.58■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Msh5Q9QUM7 833 aa16.58■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm44503E9PYU5 387 aa16.58■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 StrnO55106 780 aa16.58■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pex2P55098 305 aa16.58■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gcnt3Q5JCT0 437 aa16.58■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atp2a3Q64518 1038 aa16.58■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Chsy1Q6ZQ11 800 aa16.58■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lsm8Q6ZWM4 96 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr392Q7TRX6 312 aa16.58■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 HscbQ8K3A0 234 aa16.58■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pcdhac2Q91Y09 1006 aa16.58■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Xpo5Q924C1 1204 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 GatbQ99JT1 557 aa16.58■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ino80bQ99PT3 375 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 4921530L21RikQ9CQ47 274 aa16.58■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 4930513O06RikQ9D549 161 aa16.58■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cd97Q9Z0M6 818 aa16.58■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm3187M0QWW3 260 aa16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.2 ms