Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD94

Lin52, Protein lin-52 homolog, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin52Q8CD94 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33,3■■■□□ 2,92
Lin52Q8CD94 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Lin52Q8CD94 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,74■■■□□ 2,67
Lin52Q8CD94 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,24■■■□□ 2,59
Lin52Q8CD94 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Lin52Q8CD94 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Lin52Q8CD94 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,84■■■□□ 2,53
Lin52Q8CD94 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Lin52Q8CD94 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Lin52Q8CD94 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,72■■■□□ 2,35
Lin52Q8CD94 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Lin52Q8CD94 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Lin52Q8CD94 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Lin52Q8CD94 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Lin52Q8CD94 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Lin52Q8CD94 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Lin52Q8CD94 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,12■■■□□ 2,25
Lin52Q8CD94 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Lin52Q8CD94 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Lin52Q8CD94 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Lin52Q8CD94 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Lin52Q8CD94 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Lin52Q8CD94 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Lin52Q8CD94 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,75■■■□□ 2,19
Lin52Q8CD94 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Lin52Q8CD94 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Lin52Q8CD94 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28,57■■■□□ 2,16
Lin52Q8CD94 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Lin52Q8CD94 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,12
Lin52Q8CD94 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,25■■■□□ 2,11
Lin52Q8CD94 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Lin52Q8CD94 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Lin52Q8CD94 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
Lin52Q8CD94 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Lin52Q8CD94 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Lin52Q8CD94 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Lin52Q8CD94 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Lin52Q8CD94 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Lin52Q8CD94 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Lin52Q8CD94 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,97■■■□□ 2,07
Lin52Q8CD94 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,93■■■□□ 2,06
Lin52Q8CD94 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Lin52Q8CD94 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Lin52Q8CD94 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Lin52Q8CD94 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Lin52Q8CD94 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Lin52Q8CD94 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,76■■■□□ 2,03
Lin52Q8CD94 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Lin52Q8CD94 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,72■■■□□ 2,03
Lin52Q8CD94 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Lin52Q8CD94 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Lin52Q8CD94 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Lin52Q8CD94 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27,45■■□□□ 1,99
Lin52Q8CD94 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,44■■□□□ 1,98
Lin52Q8CD94 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Lin52Q8CD94 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Lin52Q8CD94 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Lin52Q8CD94 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,26■■□□□ 1,96
Lin52Q8CD94 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,25■■□□□ 1,95
Lin52Q8CD94 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Lin52Q8CD94 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,12■■□□□ 1,93
Lin52Q8CD94 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Lin52Q8CD94 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Lin52Q8CD94 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Lin52Q8CD94 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,98■■□□□ 1,91
Lin52Q8CD94 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Lin52Q8CD94 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Lin52Q8CD94 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Lin52Q8CD94 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Lin52Q8CD94 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Lin52Q8CD94 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Lin52Q8CD94 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26,71■■□□□ 1,87
Lin52Q8CD94 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,87
Lin52Q8CD94 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26,69■■□□□ 1,86
Lin52Q8CD94 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Lin52Q8CD94 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,64■■□□□ 1,86
Lin52Q8CD94 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26,63■■□□□ 1,85
Lin52Q8CD94 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Lin52Q8CD94 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,62■■□□□ 1,85
Lin52Q8CD94 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Lin52Q8CD94 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Lin52Q8CD94 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Lin52Q8CD94 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Lin52Q8CD94 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Lin52Q8CD94 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Lin52Q8CD94 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,44■■□□□ 1,82
Lin52Q8CD94 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Lin52Q8CD94 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Lin52Q8CD94 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,81
Lin52Q8CD94 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26,37■■□□□ 1,81
Lin52Q8CD94 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Lin52Q8CD94 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Lin52Q8CD94 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,31■■□□□ 1,8
Lin52Q8CD94 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Lin52Q8CD94 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Lin52Q8CD94 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Lin52Q8CD94 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,27■■□□□ 1,8
Lin52Q8CD94 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Lin52Q8CD94 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Lin52Q8CD94 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
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