RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000018810.9

Cbx1-201, Transcript of Chromobox protein homolog 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cbx1, Length 1,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1-201ENSMUST00000018810 5830411N06RikB3F5L4 1112 aa18.96■□□□□ 0.63
Cbx1-201ENSMUST00000018810 TertO70372 1122 aa18.96■□□□□ 0.63
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Vav1P27870 845 aa18.96■□□□□ 0.63
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hspa9P38647 679 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Akr1b8P45377 316 aa18.96■□□□□ 0.63
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Sec1P97353 368 aa18.96■□□□□ 0.63
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Runx2Q08775 607 aa18.96■□□□□ 0.63
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rnf40Q3U319 1001 aa18.96■□□□□ 0.63
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ksr1Q61097 873 aa18.96■□□□□ 0.63
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Six1Q62231 284 aa18.96■□□□□ 0.63
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Klra3Q64329 266 aa18.96■□□□□ 0.63
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fcrl5Q68SN8 596 aa18.96■□□□□ 0.63
Cbx1-201ENSMUST00000018810 RadilQ69Z89 1099 aa18.96■□□□□ 0.63
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Q80Y73 168 aa18.96■□□□□ 0.63
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ppm1kQ8BXN7 372 aa18.96■□□□□ 0.63
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ccdc134Q8C7V8 229 aa18.96■□□□□ 0.63
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mill1Q8HWE7 395 aa18.96■□□□□ 0.63
Cbx1-201ENSMUST00000018810 CtbsQ8R242 366 aa18.96■□□□□ 0.63
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tcf25Q8R3L2 676 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pomgnt1Q91X88 660 aa18.96■□□□□ 0.63
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rabl3Q9D4V7 236 aa18.96■□□□□ 0.63
Cbx1-201ENSMUST00000018810 GatmQ9D964 423 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
Cbx1-201ENSMUST00000018810 DonsonQ9QXP4 560 aa18.96■□□□□ 0.63
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rfc2Q9WUK4 349 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Bmp15Q9Z0L4 392 aa18.96■□□□□ 0.63
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cog1Q9Z160 980 aa18.96■□□□□ 0.63
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gys1Q9Z1E4 738 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm8882E9Q7E4 283 aa18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm3642K7N6V4 267 aa18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Adam15O88839 864 aa18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Soat2O88908 525 aa18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 FynP39688 537 aa18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Flt3lgP49772 232 aa18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Znf185Q62394 352 aa18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rab34Q64008 259 aa18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Myo6Q64331 1265 aa18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Jade3Q6IE82 823 aa18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Prrt3Q6PE13 971 aa18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Chn2Q80XD1 332 aa18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Taf5Q8C092 801 aa18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Trub1Q8C0D0 338 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cfap36Q8C6E0 343 aa18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rsad2Q8CBB9 362 aa18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Champ1Q8K327 802 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Igsf8Q8R366 611 aa18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zcchc14Q8VIG0 956 aa18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Spns2Q91VM4 549 aa18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rpl17Q9CPR4 184 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Capn9Q9D805 690 aa18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cpb2Q9JHH6 422 aa18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Drg2Q9QXB9 364 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Vti1aO89116 217 aa18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nudt1P53368 156 aa18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Myadml2Q08AU7 307 aa18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 B020004J07RikQ3UTC0 476 aa18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nr1d1Q3UV55 615 aa18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cyp3a13Q64464 503 aa18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Trim62Q80V85 475 aa18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Bank1Q80VH0 783 aa18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Clec2eQ80XD9 204 aa18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Sh3rf3Q8C120 878 aa18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Actl9Q8CG27 415 aa18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Stau2Q8CJ67 570 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 McmbpQ8R3C0 642 aa18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pcdhb17Q91VD8 799 aa18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Unc45aQ99KD5 944 aa18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 PigxQ99LV7 254 aa18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gemin2Q9CQQ4 269 aa18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 PlekQ9JHK5 350 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Edf1Q9JMG1 148 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Sept5Q9Z2Q6 369 aa18.95■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rp1P56716 2095 aa18.94■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm5483B2RV77 97 aa18.94■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm3336J3QMQ6 198 aa18.94■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zfp850J3QPC5 689 aa18.94■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Vmn2r111K7N674 857 aa18.94■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hes2O54792 157 aa18.94■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pim1P06803 397 aa18.94■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 PrlP06879 226 aa18.94■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mc4rP56450 332 aa18.94■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 CkbQ04447 381 aa18.94■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cntn2Q61330 1040 aa18.94■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nlrp14Q6B966 993 aa18.94■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tas2r115Q7M719 310 aa18.94■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Usp1Q8BJQ2 784 aa18.94■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fbxo38Q8BMI0 1194 aa18.94■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Sh2b1Q91ZM2 756 aa18.94■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kdelr1Q99JH8 212 aa18.94■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rilpl2Q99LE1 197 aa18.94■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cuedc2Q9CXX9 284 aa18.94■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Q9D454 513 aa18.94■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 NckipsdQ9ESJ4 714 aa18.94■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Il17rbQ9JIP3 499 aa18.94■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Vwa8Q8CC88 1905 aa18.93■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Igkv5-43A0A0B4J1J2 115 aa18.93■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ssxb9A2BI93 185 aa18.93■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm8334F7CD45 553 aa18.93■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Resp18P47939 175 aa18.93■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Aff3P51827 1254 aa18.93■□□□□ 0.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Wfs1P56695 890 aa18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.2 ms