RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A1B0GUA9 196 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 ZBBXA8MT70 800 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 MIPP30301 263 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 SDC4P31431 198 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 SCNN1AP37088 669 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC15Q0P6D6 951 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 XRCC4Q13426 336 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 ACVR2BQ13705 512 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 SETDB1Q15047 1291 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 LRRC14Q15048 493 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 NOMO1Q15155 1222 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 MTFR1Q15390 333 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 GRIK4Q16099 956 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 SNCBQ16143 134 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 SMTNL2Q2TAL5 461 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 BOLA3Q53S33 107 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 EFHC2Q5JST6 749 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 FYB2Q5VWT5 728 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 FBXW10Q5XX13 1052 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 ICE2Q659A1 982 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 OR6B2Q6IFH4 312 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 RGS9BPQ6ZS82 235 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 UNC93AQ86WB7 457 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 PALM2Q8IXS6 379 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 LRRC52Q8N7C0 313 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 BEST2Q8NFU1 509 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 FBF1Q8TES7 1133 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 MAML1Q92585 1016 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 HSPH1Q92598 858 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 KAT2BQ92831 832 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 APBB2Q92870 758 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF560Q96MR9 790 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM121Q9BTD3 319 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 CALN1Q9BXU9 219 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 SDCBP2Q9H190 292 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 ACSS3Q9H6R3 686 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 MINDY3Q9H8M7 445 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC5A4Q9NY91 659 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 PAK5Q9P286 719 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 TBK1Q9UHD2 729 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 IKBKGQ9Y6K9 419 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 CLUHO75153 1309 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 PLXNB2O15031 1838 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 E7ESA3 106 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 APOL1O14791 398 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 TM9SF1O15321 606 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 CHADO15335 359 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 GJB1P08034 283 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 CYP2C8P10632 490 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 ADORA2AP29274 412 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 ALDH3A1P30838 453 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 EPHX2P34913 555 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 PNPLA4P41247 253 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 GPD2P43304 727 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 GTF2A2P52657 109 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 NDST1P52848 882 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 CDH6P55285 790 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 PPARDQ03181 441 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 DGKDQ16760 1214 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC142Q17RM4 750 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC10A6Q3KNW5 377 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 HHATQ5VTY9 493 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 RNF43Q68DV7 783 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 CYB5D1Q6P9G0 228 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 LYPD4Q6UWN0 246 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 NAT8LQ8N9F0 302 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC63Q8NA47 563 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 GDAP1Q8TB36 358 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 SPATA18Q8TC71 538 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 LRRC8CQ8TDW0 803 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 STK32AQ8WU08 396 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 PWWP2AQ96N64 755 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 CYTH2Q99418 400 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF670Q9BS34 389 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 KLC2Q9H0B6 622 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 RNPEPQ9H4A4 650 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 RXFP1Q9HBX9 757 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 PDGFCQ9NRA1 345 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 KLC4Q9NSK0 619 aa9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms