RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 RNF157Q96PX1 679 aa30.36■■■□□ 2.45
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa30.36■■■□□ 2.45
CTDNEP1-208ENST00000573600 PATJQ8NI35 1801 aa30.36■■■□□ 2.45
CTDNEP1-208ENST00000573600 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
CTDNEP1-208ENST00000573600 RFC2P35250 354 aa30.36■■■□□ 2.45
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CTDNEP1-208ENST00000573600 LRRC43Q8N309 656 aa30.34■■■□□ 2.45
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC39A12Q504Y0 691 aa30.33■■■□□ 2.45
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CTDNEP1-208ENST00000573600 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP30.33■■■□□ 2.45
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CTDNEP1-208ENST00000573600 C11orf49Q9H6J7 331 aa30.32■■■□□ 2.44
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CTDNEP1-208ENST00000573600 H3BQF6 201 aa30.3■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 APOL1O14791 398 aa30.3■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 MCF2LO15068 1137 aa30.3■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 GGCXP38435 758 aa30.3■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 AIF1P55008 147 aa30.3■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 BCAR1P56945 870 aa30.3■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 DEUP1Q05D60 604 aa30.3■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 CTXN3Q4LDR2 81 aa30.3■■■□□ 2.44
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