RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571409.1

CTDNEP1-206, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CTDNEP1-206ENST00000571409 RWDD2AQ9UIY3 292 aa31.85■■■□□ 2.69
CTDNEP1-206ENST00000571409 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa31.84■■■□□ 2.69
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