RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	NAGPA	Q9UK23	515 aa		22.91	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		22.91	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		22.91	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		22.91	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	TULP2	O00295	520 aa		22.91	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	IRF1	P10914	325 aa		22.91	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	SGO2	Q562F6	1265 aa		22.91	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		22.91	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		22.91	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		22.91	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		22.91	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	PNKP	Q96T60	521 aa		22.91	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		22.91	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	NCDN	Q9UBB6	729 aa		22.91	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		22.91	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	MDM4	O15151	490 aa		22.9	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	22.9	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	TGM1	P22735	817 aa		22.9	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	22.9	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	GAD2	Q05329	585 aa		22.9	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	PDE4C	Q08493	712 aa		22.9	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNH2	Q12809	1159 aa		22.9	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	22.9	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		22.9	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	PKDCC	Q504Y2	493 aa		22.9	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		22.9	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM25	Q86YD3	366 aa		22.9	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		22.9	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	KAT5	Q92993	513 aa		22.9	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	ACD	Q96AP0	544 aa		22.9	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		22.9	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200		O00370	1275 aa		22.89	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	22.89	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	KAT7	O95251	611 aa		22.89	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	VDR	P11473	427 aa		22.89	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	PLA2G4A	P47712	749 aa		22.89	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	BCAT1	P54687	386 aa		22.89	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC8A3	P57103	927 aa		22.89	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	CETN1	Q12798	172 aa		22.89	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	LPAL2	Q16609	132 aa		22.89	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		22.89	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		22.89	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		22.89	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		22.89	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	TFAP2B	Q92481	460 aa		22.89	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		22.89	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	22.88	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	PAEP	P09466	180 aa		22.88	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	TKTL1	P51854	596 aa		22.88	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	GCNT1	Q02742	428 aa		22.88	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	22.88	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	DMC1	Q14565	340 aa		22.88	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM270	Q6UE05	265 aa		22.88	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200		Q6ZNB5	142 aa		22.88	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		22.88	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		22.88	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		22.88	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	HHIP	Q96QV1	700 aa		22.88	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	22.88	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		22.88	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	22.87	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	STC2	O76061	302 aa		22.87	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	22.87	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	RALA	P11233	206 aa		22.87	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	CD19	P15391	556 aa		22.87	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	GRIA2	P42262	883 aa		22.87	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	SEC13	P55735	322 aa		22.87	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	22.87	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		22.87	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		22.87	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	C2orf27A	Q580R0	203 aa		22.87	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		22.87	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		22.87	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	22.87	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		22.87	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	MARK1	Q9P0L2	795 aa		22.87	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	HESX1	Q9UBX0	185 aa		22.87	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	EBF1	Q9UH73	591 aa		22.87	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB23	Q9ULC3	237 aa		22.87	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	22.87	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	TULP3	O75386	442 aa		22.86	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	ZBED1	O96006	694 aa		22.86	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	APOD	P05090	189 aa		22.86	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC192	P0DO97	292 aa		22.86	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	22.86	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF132	P52740	706 aa		22.86	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	RRAGA	Q7L523	313 aa		22.86	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		22.86	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	UBA3	Q8TBC4	463 aa		22.86	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	GAB3	Q8WWW8	586 aa		22.86	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		22.86	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		22.86	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		22.86	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	22.86	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		22.86	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		22.86	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		22.86	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	LAMA1	P25391	3075 aa		22.86	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	22.85	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	APBB3	O95704	486 aa		22.85	■■□□□ 1.25

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