RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559642.1

BMP4-208, Transcript of bone morphogenetic protein 4, human

TSL 3

Gene BMP4, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BMP4-208	ENST00000559642	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	MIIP	Q5JXC2	388 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	C12orf40	Q86WS4	652 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	MIB1	Q86YT6	1006 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	IER2	Q9BTL4	223 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	SIX2	Q9NPC8	291 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	PRR23A	A6NEV1	266 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	ANTXRL	A6NF34	631 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	BECN2	A8MW95	431 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	GREM1	O60565	184 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	RNF40	O75150	1001 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	GABBR2	O75899	941 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	ZBED1	O96006	694 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	HMBS	P08397	361 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	ADH5	P11766	374 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	TDGF1	P13385	188 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	USP8	P40818	1118 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	PSEN1	P49768	467 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	CCR3	P51677	355 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	MFAP3	P55082	362 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	KDSR	Q06136	332 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	DMWD	Q09019	674 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	EFEMP1	Q12805	493 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	CNGA2	Q16280	664 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	VWA3B	Q502W6	1294 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	PMF1	Q6P1K2	205 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	NDST4	Q9H3R1	872 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642		E7ENQ6	273 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	STC2	O76061	302 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	ADH1C	P00326	375 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	DRD1	P21728	446 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	CXCL12	P48061	93 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	SLC6A11	P48066	632 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	MESP2	Q0VG99	397 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	STIL	Q15468	1287 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	STX1A	Q16623	288 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	EDEM1	Q92611	657 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642		K7ESF4	209 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BMP4-208	ENST00000559642	THAP12	O43422	761 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BMP4-208	ENST00000559642	GNA15	P30679	374 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BMP4-208	ENST00000559642	SEC13	P55735	322 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BMP4-208	ENST00000559642	DAOA	P59103	153 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BMP4-208	ENST00000559642	ANO4	Q32M45	955 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BMP4-208	ENST00000559642	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
BMP4-208	ENST00000559642	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BMP4-208	ENST00000559642	HTR3D	Q70Z44	454 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BMP4-208	ENST00000559642	TMEM25	Q86YD3	366 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BMP4-208	ENST00000559642	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BMP4-208	ENST00000559642	NAT16	Q8N8M0	369 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BMP4-208	ENST00000559642	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BMP4-208	ENST00000559642	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
BMP4-208	ENST00000559642	SHC3	Q92529	594 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BMP4-208	ENST00000559642	NELL1	Q92832	810 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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