RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357207.8

TRAPPC11-202, Transcript of trafficking protein particle complex 11, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC11, Length 4,435 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11-202ENST00000357207 LPCAT2Q7L5N7 544 aa16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC11-202ENST00000357207 C4orf32Q8N8J7 132 aa16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC11-202ENST00000357207 TMEM79Q9BSE2 394 aa16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC11-202ENST00000357207 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC11-202ENST00000357207 PREX1Q8TCU6 1659 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 TISP43B9A030 160 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 F8VP50 259 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 TBC1D12O60347 775 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 PRKAA1Q13131 559 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 STKLD1Q8NE28 680 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 SIKE1Q9BRV8 207 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 GGA3Q9NZ52 723 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 HIST1H2ADP20671 130 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 TAF6P49848 677 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 GEMP55040 296 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 DLG4P78352 724 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 CHRNB3Q05901 458 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 FAM71AQ8IYT1 594 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 EFHBQ8N7U6 833 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 TBCBQ99426 244 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 HIST1H2AJQ99878 128 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 C17orf80Q9BSJ5 609 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 H2AFJQ9BTM1 129 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 WDCPQ9H6R7 721 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 FSCN2O14926 492 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 SOAT2O75908 522 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 APOC2P02655 101 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 CYP1A2P05177 515 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 ABHD2P08910 425 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 ME2P23368 584 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 ATP6V1E1P36543 226 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 KRT72Q14CN4 511 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 HGSNATQ68CP4 663 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 RNF148Q8N7C7 305 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 OR6J1Q8NGC5 347 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 RIN3Q8TB24 985 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 RHOBTB1O94844 696 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 CPB1P15086 417 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 CYP2F1P24903 491 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 PNPLA4P41247 253 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 GPR162Q16538 588 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 TRIM60Q495X7 471 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 RRM2BQ7LG56 351 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 PKP3Q9Y446 797 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 JCHAINP01591 159 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 HLA-DPA1P20036 260 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 CHKAP35790 457 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 RAP1GAPP47736 663 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 POU4F1Q01851 419 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 DGKDQ16760 1214 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 ZFP1Q6P2D0 407 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 MICALL2Q8IY33 904 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 SHPRHQ149N8 1683 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 HEATR9A2RTY3 570 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 EVPLLA8MZ36 301 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 WDR47O94967 919 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 NPTXRO95502 500 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 ATP6V1C1P21283 382 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 CLCN3P51790 818 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 RUNX1T1Q06455 604 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 DPYSL3Q14195 570 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 TTC23LQ6PF05 361 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 CCDC81Q6ZN84 652 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 MAP4K3Q8IVH8 894 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 PYDC1Q8WXC3 89 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 SHC3Q92529 594 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 KCNQ5Q9NR82 932 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 UBDO15205 165 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 VIL1P09327 827 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 RGS4P49798 205 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 RAD51Q06609 339 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 AMHR2Q16671 573 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 FUT11Q495W5 492 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 CDRT15Q96T59 188 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC11-202ENST00000357207 AFF2P51816 1311 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.5 ms